More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1476 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  100 
 
 		 629 aa  1300    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1459  histidine kinase  54.19 
 
 		 405 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.855537  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  30.15 
 
 		 933 aa  196  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  29.3 
 
 		 931 aa  184  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1580  ATP-binding region ATPase domain protein  39.2 
 
 		 497 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  31.64 
 
 		 932 aa  177  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  30.65 
 
 		 934 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0259  histidine kinase  34.3 
 
 		 389 aa  141  4.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156401  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  29.84 
 
 		 381 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002115  sensory box/GGDEF family protein  26.73 
 
 		 828 aa  126  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0273  ATP-binding region ATPase domain protein  36.71 
 
 		 393 aa  125  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00305  sensory transduction protein kinase  28.06 
 
 		 828 aa  121  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  25.89 
 
 		 1101 aa  120  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  27.61 
 
 		 395 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0137  sensor histidine kinase  37.86 
 
 		 375 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  26.91 
 
 		 1852 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  27.44 
 
 		 377 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1918  putative two-component sensor  30.43 
 
 		 372 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0841  sensor histidine kinase  32.09 
 
 		 374 aa  112  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0909327  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0256  ATP-binding region ATPase domain protein  30.52 
 
 		 379 aa  110  7.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0385  putative two-component sensor  30.09 
 
 		 368 aa  109  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0688  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.35 
 
 		 951 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00399648  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0096  ATP-binding region ATPase domain protein  32.18 
 
 		 395 aa  107  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  25 
 
 		 373 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1774  histidine kinase  32.52 
 
 		 290 aa  105  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  25.15 
 
 		 365 aa  104  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1279  sensor histidine kinase  33.8 
 
 		 388 aa  104  5e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00018737  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2389  GGDEF family protein  24.35 
 
 		 829 aa  103  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0529  sensor histidine kinase  36.15 
 
 		 388 aa  99.8  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  25.15 
 
 		 387 aa  99.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  24.39 
 
 		 379 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0885  histidine kinase  31.16 
 
 		 331 aa  97.4  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.096312  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  25.68 
 
 		 387 aa  96.3  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1366  histidine kinase  31.82 
 
 		 371 aa  92.8  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0489187  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1235  sensor histidine kinase  29.81 
 
 		 353 aa  91.7  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000222357  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1357  sensor histidine kinase  29.81 
 
 		 396 aa  91.3  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  25.81 
 
 		 395 aa  91.3  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0127  two-component sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 435 aa  90.9  6e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.202899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1503  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.41 
 
 		 947 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  24.77 
 
 		 379 aa  89.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1325  hypothetical protein  32.51 
 
 		 389 aa  89.7  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.219372  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1102  two-component sensor histidine kinase  30 
 
 		 407 aa  86.3  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.588024  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  24.51 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  26.98 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4941  sensor histidine kinase  23.87 
 
 		 799 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176481  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0626  histidine kinase  28.37 
 
 		 256 aa  80.5  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.657871  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3258  hypothetical protein  33.55 
 
 		 166 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 500 aa  74.3  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 1138 aa  73.9  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  24.8 
 
 		 441 aa  73.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.06 
 
 		 672 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  24.8 
 
 		 1348 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1545  histidine kinase  29.49 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  26.15 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  23.56 
 
 		 441 aa  70.1  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  26.9 
 
 		 420 aa  70.1  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 		 816 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 459 aa  70.1  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  24.23 
 
 		 582 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 587 aa  70.1  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2475  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 585 aa  70.1  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130335  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  25.7 
 
 		 383 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 757 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.856998  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 1131 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  25.34 
 
 		 501 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 453 aa  69.7  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  27.83 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2570  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 515 aa  68.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.283678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1922  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 558 aa  68.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1984  PAS sensor protein  28.19 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.117644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 816 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2957  sensor histidine kinase  26.84 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.882031  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0121  ATP-binding region ATPase domain protein  26.83 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 		 498 aa  68.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3717  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.31 
 
 		 663 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143813 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0977  histidine kinase  24.78 
 
 		 551 aa  67.8  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0254133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  23.95 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  29.06 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.3 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  27.36 
 
 		 480 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  26.73 
 
 		 480 aa  67  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1491  phosphate regulon sensor protein PhoR  26.75 
 
 		 436 aa  67  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.690525  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0988  sensor histidine kinase ArlS  25.87 
 
 		 456 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101467  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03600  histidine kinase  24.73 
 
 		 432 aa  66.6  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0707295 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0571  histidine protein kinase PhoR  26.75 
 
 		 448 aa  67  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0483305  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0786  histidine protein kinase PhoR  26.75 
 
 		 436 aa  67  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  27.65 
 
 		 1222 aa  66.6  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 		 462 aa  66.6  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1297  histidine protein kinase PhoR  26.75 
 
 		 436 aa  67  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0580  histidine protein kinase PhoR  26.75 
 
 		 436 aa  67  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211794  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  25.22 
 
 		 621 aa  67  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.52 
 
 		 663 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1997  histidine kinase/response regulator hybrid protein  26.42 
 
 		 558 aa  67  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.947527  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2302  histidine kinase  23.5 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110141  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0876  histidine kinase  28.32 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0168855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>