96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0877 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 
65 aa  130  5e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0838  ThiS, thiamine-biosynthesis  53.03 
 
 
67 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 
75 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  40 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  36.92 
 
 
98 aa  52  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2584  hypothetical protein  34.38 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5919  sulfur carrier protein ThiS  38.46 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.43 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
73 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 
69 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.77 
 
 
67 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  32.84 
 
 
67 aa  47.4  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1416  sulfur carrier protein ThiS  32.84 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153528  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  30.3 
 
 
329 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  30.3 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  31.25 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2390  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233708  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.24 
 
 
73 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  30.77 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
67 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  38.81 
 
 
327 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1555  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0010  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 
65 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.209764 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  36.92 
 
 
65 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 
73 aa  43.9  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0368  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 
63 aa  43.5  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000158622  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.16 
 
 
68 aa  43.5  0.0009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0072  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.89 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0444  sulfur carrier protein ThiS  36.92 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.31 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.12 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.12 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.12 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.75 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.26 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0963  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.29 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.72 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0578  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.86 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3944  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 
71 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 
71 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.75 
 
 
63 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2519  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 
66 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2072  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0579  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 
70 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.16999  hitchhiker  0.00610226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2638  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.34 
 
 
68 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.48 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.72 
 
 
70 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.38 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.1 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  34.85 
 
 
326 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.31 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.77 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  37.1 
 
 
374 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1432  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0567426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1334  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0203428  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  36.92 
 
 
65 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 
67 aa  40.4  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1679  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000223825  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 
70 aa  40.4  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1135  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 
66 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.477207  normal  0.0493363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>