More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0515 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A3948  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.03 
 
 
460 aa  648    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.440283  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03616  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.03 
 
 
460 aa  648    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  68.03 
 
 
460 aa  648    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.89 
 
 
470 aa  667    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.72 
 
 
474 aa  652    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4240  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.53 
 
 
458 aa  637    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.695259  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0012  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.53 
 
 
460 aa  642    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4262  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.03 
 
 
460 aa  648    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.227124  normal  0.244926 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.15 
 
 
475 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.88 
 
 
468 aa  642    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0062  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.33 
 
 
461 aa  657    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.64 
 
 
465 aa  838    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.71 
 
 
537 aa  647    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.68 
 
 
521 aa  647    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 
463 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5599  ATP synthase F1, beta subunit  68.68 
 
 
459 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.95 
 
 
469 aa  640    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.95 
 
 
469 aa  640    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.83 
 
 
462 aa  659    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.95 
 
 
469 aa  640    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4486  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.1 
 
 
458 aa  635    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121569 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3053  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.97 
 
 
458 aa  646    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2910  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.97 
 
 
458 aa  646    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.19 
 
 
509 aa  656    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5121  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.68 
 
 
459 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6635  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.83 
 
 
484 aa  665    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.13 
 
 
458 aa  656    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  87.1 
 
 
465 aa  840    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4607  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.82 
 
 
458 aa  641    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.1 
 
 
463 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2797  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 
459 aa  646    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.72 
 
 
476 aa  652    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.89 
 
 
478 aa  669    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 
478 aa  646    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58444  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.47 
 
 
458 aa  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5730  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.03 
 
 
458 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.15 
 
 
475 aa  655    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.82 
 
 
468 aa  679    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.82 
 
 
468 aa  679    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.84 
 
 
517 aa  657    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.05 
 
 
482 aa  662    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3845  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.1 
 
 
458 aa  634    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208529 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.48 
 
 
462 aa  663    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4507  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.1 
 
 
463 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0605714 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.89 
 
 
470 aa  667    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.34 
 
 
470 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.45 
 
 
464 aa  640    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.95 
 
 
469 aa  640    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.47 
 
 
468 aa  784    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4202  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.47 
 
 
460 aa  651    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16362  normal  0.223697 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.64 
 
 
465 aa  838    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4176  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.47 
 
 
460 aa  651    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0938283  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.67 
 
 
463 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.145707 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.63 
 
 
474 aa  655    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.96 
 
 
462 aa  647    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2148  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.33 
 
 
461 aa  647    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.85 
 
 
476 aa  660    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.39 
 
 
481 aa  642    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1466  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.05 
 
 
485 aa  660    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0580828 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.74 
 
 
469 aa  639    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.3 
 
 
474 aa  649    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.58 
 
 
474 aa  657    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  90.75 
 
 
465 aa  866    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.64 
 
 
476 aa  661    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.93 
 
 
476 aa  650    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.76 
 
 
470 aa  665    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4226  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.47 
 
 
460 aa  651    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.64 
 
 
476 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3284  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
458 aa  637    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.79 
 
 
476 aa  657    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  68.44 
 
 
530 aa  657    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0176  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.33 
 
 
483 aa  647    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4247  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.03 
 
 
460 aa  648    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000144412  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.94 
 
 
474 aa  666    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4462  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.6 
 
 
458 aa  647    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718336  hitchhiker  0.0000000225829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6356  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.47 
 
 
458 aa  642    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.96 
 
 
471 aa  668    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4295  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.25 
 
 
461 aa  646    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.797845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.3 
 
 
519 aa  655    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4898  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.97 
 
 
458 aa  642    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.19623 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4132  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.25 
 
 
460 aa  646    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.364679  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.7 
 
 
475 aa  668    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.18 
 
 
457 aa  645    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  90.11 
 
 
465 aa  860    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0008  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.6 
 
 
460 aa  641    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.366806  normal  0.022382 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4100  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.03 
 
 
460 aa  648    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.740687  normal  0.359635 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.33 
 
 
458 aa  647    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5200  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.25 
 
 
458 aa  636    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.378441  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.17 
 
 
471 aa  669    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.57 
 
 
480 aa  657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0218  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.49 
 
 
482 aa  659    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.933064  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73240  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.47 
 
 
458 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.89 
 
 
463 aa  637    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1732  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.68 
 
 
521 aa  647    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  85.59 
 
 
465 aa  831    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.1 
 
 
463 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.25 
 
 
484 aa  667    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106818  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 
481 aa  649    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 
469 aa  638    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  86.21 
 
 
484 aa  834    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>