More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3434 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3434  oxidoreductase, FAD-binding  100 
 
 
674 aa  1406    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000581743 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.15 
 
 
678 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  36.85 
 
 
678 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.67 
 
 
700 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.85 
 
 
678 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  36.63 
 
 
691 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.02 
 
 
687 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.55 
 
 
690 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.21 
 
 
682 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.644036  decreased coverage  0.000684551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.8 
 
 
681 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5418  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.38 
 
 
684 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.92 
 
 
686 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  35.7 
 
 
676 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  36.15 
 
 
675 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4692  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.44 
 
 
692 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3671  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.44 
 
 
692 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.31 
 
 
689 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587017  normal  0.619403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.04 
 
 
687 aa  429  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.2 
 
 
676 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.96 
 
 
684 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.81 
 
 
691 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  34.52 
 
 
711 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0662  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.58 
 
 
668 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.935867  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43312  predicted protein  31.71 
 
 
627 aa  271  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2244  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  41.61 
 
 
313 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.856574  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1905  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  41.03 
 
 
321 aa  246  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.203473  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0646  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  43.08 
 
 
316 aa  245  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0408  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  40.07 
 
 
820 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5039  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40.45 
 
 
321 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.418907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.31 
 
 
323 aa  238  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2438  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.74 
 
 
713 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145248  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1915  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.46 
 
 
353 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4441  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.04 
 
 
445 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3093  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.82 
 
 
304 aa  219  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0622009 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1434  nitric oxide dioxygenase  31.93 
 
 
586 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0387765  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4730  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.82 
 
 
311 aa  213  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115122  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2815  MOSC domain-containing protein  34.29 
 
 
596 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.431802  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.15 
 
 
412 aa  212  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.74 
 
 
307 aa  211  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  34.57 
 
 
586 aa  210  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24820  hypothetical protein  39.6 
 
 
310 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.447452  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5004  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.77 
 
 
308 aa  209  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  0.460279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0911  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.36 
 
 
317 aa  209  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6438  MOSC domain containing protein  33.62 
 
 
586 aa  207  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4050  hypothetical protein  36.94 
 
 
330 aa  206  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.604915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1058  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.5 
 
 
310 aa  206  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300031  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2668  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  39.58 
 
 
399 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2815  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  38.78 
 
 
414 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1070  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  38.78 
 
 
714 aa  206  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2103  hypothetical protein  39.3 
 
 
310 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3068  MOSC domain containing protein  34.2 
 
 
588 aa  204  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3827  MOSC domain containing protein  34.01 
 
 
590 aa  203  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143963  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0798  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.22 
 
 
307 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4124  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.79 
 
 
306 aa  201  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0108  hypothetical protein  39.3 
 
 
410 aa  200  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1269  hypothetical protein  39.3 
 
 
419 aa  200  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4951  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.41 
 
 
306 aa  198  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  31.1 
 
 
390 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4488  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.41 
 
 
305 aa  197  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1307  hypothetical protein  39.33 
 
 
305 aa  196  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  32.95 
 
 
581 aa  183  9.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  38.65 
 
 
411 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  35.09 
 
 
402 aa  180  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  36.49 
 
 
402 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  35.44 
 
 
402 aa  179  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  35.09 
 
 
402 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  35.48 
 
 
394 aa  177  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  34.39 
 
 
402 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  34.39 
 
 
402 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  34.39 
 
 
402 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1223  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  34.81 
 
 
314 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.0162302 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  35.6 
 
 
409 aa  174  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  34.04 
 
 
402 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  34.04 
 
 
402 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  34.04 
 
 
402 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  34.52 
 
 
396 aa  172  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.62 
 
 
403 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  32.62 
 
 
394 aa  170  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  34.39 
 
 
402 aa  170  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5761  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:oxidoreductase FAD-binding region  29.16 
 
 
1142 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2905  fused nitric oxide dioxygenase and dihydropteridine reductase  33.69 
 
 
396 aa  167  8e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  31.88 
 
 
393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  32.04 
 
 
403 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1972  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.52 
 
 
403 aa  162  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  37.01 
 
 
397 aa  161  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  31.9 
 
 
394 aa  160  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  36.21 
 
 
397 aa  160  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  31.54 
 
 
393 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  36.61 
 
 
397 aa  160  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1304  nitric oxide dioxygenase  36.18 
 
 
393 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.7 
 
 
402 aa  159  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  36.21 
 
 
397 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  33.46 
 
 
403 aa  158  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0847  nitric oxide dioxygenase  31.08 
 
 
392 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  35.69 
 
 
397 aa  158  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1874  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.61 
 
 
284 aa  158  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  35.8 
 
 
397 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  35.12 
 
 
396 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.51 
 
 
393 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0808  nitric oxide dioxygenase  31.08 
 
 
392 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>