296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2525 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1753  methyltransferase type 11  89.03 
 
 		 367 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.757271  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2525  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 383 aa  788    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1797  methyltransferase type 11  92.69 
 
 		 374 aa  699    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.105535  normal  0.766979 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1760  methyltransferase type 11  90.18 
 
 		 320 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2343  biotin biosynthesis protein BioC  55.31 
 
 		 269 aa  320  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2429  biotin biosynthesis protein BioC  54.43 
 
 		 275 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0131748 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  53.77 
 
 		 275 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2738  biotin synthesis protein BioC  54.1 
 
 		 275 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  52.13 
 
 		 275 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  43.51 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2774  biotin biosynthesis protein BioC  43.56 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0014139  hitchhiker  0.00911196 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1803  methyltransferase type 11  39.87 
 
 		 256 aa  219  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1477  methyltransferase type 11  39.55 
 
 		 254 aa  215  9e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1440  biotin synthesis protein BioC  40.58 
 
 		 248 aa  210  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00159982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1868  methyltransferase type 11  37.35 
 
 		 263 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00760268  decreased coverage  0.000000322294 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1660  methyltransferase type 11  38.01 
 
 		 309 aa  203  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  30.12 
 
 		 260 aa  96.7  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  26.25 
 
 		 270 aa  96.3  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  33.77 
 
 		 255 aa  96.3  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  30.25 
 
 		 274 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  29.69 
 
 		 272 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  32.23 
 
 		 253 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  32.08 
 
 		 253 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  28.48 
 
 		 267 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  29.9 
 
 		 272 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  31.65 
 
 		 268 aa  90.9  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  29.41 
 
 		 274 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  29.9 
 
 		 276 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  31.28 
 
 		 275 aa  89  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  26.42 
 
 		 558 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  34.34 
 
 		 267 aa  86.7  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  34.34 
 
 		 267 aa  86.7  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  29.01 
 
 		 275 aa  86.3  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  28.38 
 
 		 251 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 267 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  34.34 
 
 		 267 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  28.38 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  28.38 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  28.38 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  28.38 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  28.38 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  28.38 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  27.16 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  29.28 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  29.6 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  31.02 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  28.38 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  28.38 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  28.83 
 
 		 251 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 315 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  30.8 
 
 		 268 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  26.14 
 
 		 269 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  29.79 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  30.09 
 
 		 272 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  30.45 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  28.83 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  28.1 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  28.38 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  29.63 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  26.34 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  26.21 
 
 		 269 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  28.25 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  29.05 
 
 		 253 aa  75.9  0.000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  28.85 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  25.45 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  24.4 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  33.91 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  24.25 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  27.35 
 
 		 251 aa  69.3  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  23.7 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  25.09 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  28.95 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  26.14 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  24.14 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  25.42 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  23.46 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  23.46 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  20.31 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  20.31 
 
 		 284 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  23.55 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  27.59 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.19 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.57 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  27.52 
 
 		 268 aa  57  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  40.98 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  37.68 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  24.29 
 
 		 279 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2739  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  41.18 
 
 		 201 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2360  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 201 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175254  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  24.29 
 
 		 321 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  26.26 
 
 		 234 aa  54.3  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  24.29 
 
 		 321 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  25.4 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  33 
 
 		 258 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  38.27 
 
 		 254 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.83 
 
 		 207 aa  53.9  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  28.82 
 
 		 267 aa  53.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4435  methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 247 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 289 aa  53.1  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>