67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3121 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  100 
 
 
150 aa  295  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  53.38 
 
 
149 aa  120  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  48.06 
 
 
156 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  48.06 
 
 
156 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  48.06 
 
 
157 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  40.71 
 
 
240 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  46.09 
 
 
190 aa  91.3  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  41.67 
 
 
183 aa  90.9  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  40 
 
 
219 aa  88.2  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  42.22 
 
 
189 aa  86.7  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  37.76 
 
 
236 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  4.23537e-09 
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  37.32 
 
 
177 aa  84.7  4e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  40.71 
 
 
215 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  44.76 
 
 
187 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  41.18 
 
 
205 aa  83.6  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  36.76 
 
 
231 aa  83.2  1e-15  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  40.15 
 
 
222 aa  82.8  1e-15  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  40.15 
 
 
222 aa  82.8  1e-15  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  43.36 
 
 
187 aa  82.8  1e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  37.5 
 
 
174 aa  82.8  1e-15  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  43.36 
 
 
187 aa  82.4  2e-15  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  42.22 
 
 
248 aa  82  2e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  38 
 
 
228 aa  82.8  2e-15  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  44 
 
 
159 aa  81.3  4e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  40.85 
 
 
184 aa  80.9  5e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  1.00699e-05 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  36.96 
 
 
228 aa  80.9  6e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  38.46 
 
 
248 aa  80.9  6e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  39.01 
 
 
215 aa  79.7  1e-14  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  41.91 
 
 
235 aa  79.3  1e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  39.72 
 
 
240 aa  80.1  1e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  34.27 
 
 
579 aa  80.1  1e-14  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  37.96 
 
 
172 aa  79.3  2e-14  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  38.41 
 
 
177 aa  79  2e-14  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  38.41 
 
 
177 aa  79.3  2e-14  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  38.73 
 
 
233 aa  78.6  3e-14  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  5.25183e-05 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  44.27 
 
 
185 aa  78.2  3e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  40.43 
 
 
220 aa  78.2  3e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  41.3 
 
 
371 aa  76.3  1e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  39.44 
 
 
216 aa  75.9  2e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  39.39 
 
 
144 aa  75.9  2e-13  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  36.5 
 
 
183 aa  75.5  2e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  39.44 
 
 
216 aa  74.3  5e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.50589e-08 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  34.81 
 
 
177 aa  73.9  7e-13  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  33.33 
 
 
176 aa  72.8  1e-12  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  39.39 
 
 
165 aa  71.6  3e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  41.46 
 
 
244 aa  70.5  7e-12  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  32.39 
 
 
177 aa  69.3  2e-11  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  36.5 
 
 
526 aa  65.5  2e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  36.5 
 
 
526 aa  65.5  2e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  36.5 
 
 
526 aa  65.5  2e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  37.59 
 
 
171 aa  63.2  1e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  31.11 
 
 
165 aa  60.5  8e-09  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  33.77 
 
 
243 aa  58.9  2e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  25.87 
 
 
180 aa  57.4  7e-08  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  32.82 
 
 
167 aa  55.8  2e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  34.07 
 
 
168 aa  54.3  5e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  30.2 
 
 
250 aa  52.8  2e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  36.84 
 
 
139 aa  52  3e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  30.77 
 
 
233 aa  50.1  9e-06  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  33.33 
 
 
165 aa  50.1  1e-05  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  33.33 
 
 
165 aa  50.1  1e-05  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  29.58 
 
 
213 aa  47.4  7e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  29.63 
 
 
649 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5151  HK97 family phage prohead protease  30.53 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  35.85 
 
 
420 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0239  peptidase U35 phage prohead HK97  27.18 
 
 
206 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1717  prohead protease  26.92 
 
 
525 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>