155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0065 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0065  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  100 
 
 
264 aa  521  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2782  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  65.38 
 
 
256 aa  331  7.000000000000001e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.674441  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9016  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  55.95 
 
 
259 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  0.212694 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  47.33 
 
 
265 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1532  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  46.46 
 
 
254 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0743  hypothetical protein  41.53 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848227  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0910  hypothetical protein  46.58 
 
 
261 aa  172  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4668  hypothetical protein  39.1 
 
 
266 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  39.76 
 
 
258 aa  169  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2447  hypothetical protein  42.91 
 
 
261 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1704  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  43.95 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.332773  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2243  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  45.56 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241494  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1631  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  43.95 
 
 
262 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.995531  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5751  hypothetical protein  38.74 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3111  hypothetical protein  31.6 
 
 
295 aa  112  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4707  hypothetical protein  27.38 
 
 
282 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161538  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0098  hypothetical protein  33.6 
 
 
277 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.080433  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3083  hypothetical protein  35.34 
 
 
266 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00986459 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  25.75 
 
 
307 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  31.27 
 
 
268 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4915  putative Zn-dependent hydrolase of beta- lactamase fold family  33.2 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 
255 aa  89.4  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03400  hypothetical protein  27.18 
 
 
366 aa  79  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03523  conserved hypothetical protein  26.87 
 
 
340 aa  78.6  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.077158  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2498  beta-lactamase domain-containing protein  26.59 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0684369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2548  beta-lactamase domain-containing protein  26.59 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10421  conserved hypothetical protein  25.6 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.876476 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1482  hypothetical protein  25.79 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  27.91 
 
 
392 aa  72  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1858  hypothetical protein  26.52 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00276087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  28.7 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  28.7 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  28.7 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  27.73 
 
 
324 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  28.7 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  27.31 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000899  membrane protein  27.42 
 
 
414 aa  65.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  28.32 
 
 
423 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1544  hypothetical protein  30.7 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.133061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  31.6 
 
 
335 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2954  Beta-lactamase-like  26.83 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938277  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  27.73 
 
 
324 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  28.7 
 
 
324 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  27.78 
 
 
324 aa  63.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  29 
 
 
336 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  28.39 
 
 
388 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.76 
 
 
590 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  27.43 
 
 
351 aa  60.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.91 
 
 
335 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  27 
 
 
361 aa  60.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1365  putative secreted protein  30.04 
 
 
299 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  28.69 
 
 
377 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 
324 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4971  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1801  beta-lactamase  31.3 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.204896  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.92 
 
 
419 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 
332 aa  57  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  26.7 
 
 
233 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2243  hypothetical protein  31.28 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  0.828679 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2326  hypothetical protein  24.9 
 
 
309 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0500468 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  29.65 
 
 
376 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0760  beta-lactamase domain protein  27.75 
 
 
237 aa  55.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.31 
 
 
374 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  28.57 
 
 
358 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  29.86 
 
 
335 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  27.88 
 
 
363 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  27.2 
 
 
374 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.08 
 
 
374 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  27.52 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  28.57 
 
 
376 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  26.34 
 
 
362 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  27.56 
 
 
361 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  30.83 
 
 
357 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  28.08 
 
 
374 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  27.78 
 
 
369 aa  53.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  28.08 
 
 
374 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6275  hypothetical protein  28.35 
 
 
281 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0666  beta-lactamase domain protein  24.32 
 
 
229 aa  52.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389415  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  30.4 
 
 
362 aa  52.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  30.65 
 
 
360 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  26.09 
 
 
351 aa  52.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1063  beta-lactamase domain protein  30.06 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0526  beta-lactamase domain protein  27.2 
 
 
298 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  26.07 
 
 
376 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.54 
 
 
374 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  25.48 
 
 
333 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25 
 
 
380 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2597  beta-lactamase-like protein  24.22 
 
 
299 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  30.5 
 
 
365 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2477  exported protein  27.08 
 
 
250 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102477  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  25.31 
 
 
320 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  27.6 
 
 
381 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  28.65 
 
 
226 aa  49.7  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  26.38 
 
 
225 aa  49.3  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  28.09 
 
 
380 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  28.49 
 
 
242 aa  48.9  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0767  metal-dependent hydrolase  27.44 
 
 
226 aa  48.9  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  26.38 
 
 
320 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  23.77 
 
 
320 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38719  predicted protein  28.28 
 
 
457 aa  48.5  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248337  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>