69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0687 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 254 aa  503  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  61.63 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  57.02 
 
 		 248 aa  242  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  47.5 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  45.28 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  44.9 
 
 		 249 aa  184  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  42.35 
 
 		 265 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  42.52 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  46.25 
 
 		 261 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  44.35 
 
 		 290 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  43.9 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  42.19 
 
 		 254 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  42.19 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  40.87 
 
 		 247 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  43.86 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  42.41 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  43.41 
 
 		 257 aa  168  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  47.3 
 
 		 252 aa  168  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  43.36 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  42.5 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  43.33 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  46.52 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  42.32 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  45.19 
 
 		 264 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  35.42 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  34.02 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  43.51 
 
 		 271 aa  156  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  40.34 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  38.53 
 
 		 257 aa  155  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  41.91 
 
 		 647 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  42.68 
 
 		 283 aa  152  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  34.02 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  40.44 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  37.72 
 
 		 272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  42.86 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  38.91 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  36.4 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  34.66 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  41.99 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  39.02 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  41.56 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  39.73 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  34.09 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  34.09 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  29.13 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  28.72 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  40.22 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  27.6 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  25.23 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  29.88 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  28.02 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 361 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 		 267 aa  45.4  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  25.46 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  25 
 
 		 279 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  25 
 
 		 279 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  28.12 
 
 		 415 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1197  lysophospholipase L2, putative  24.35 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  26.01 
 
 		 292 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  28.86 
 
 		 409 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.35 
 
 		 372 aa  42.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 269 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0509  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 		 275 aa  42  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.391002 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  25.25 
 
 		 408 aa  42  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1447  alpha/beta hydrolase fold protein  32.23 
 
 		 271 aa  42  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>