More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0409 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  100 
 
 
317 aa  640  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.64225e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  40.13 
 
 
322 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0912  Polyprenyl synthetase  43.1 
 
 
312 aa  235  6e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0418451  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  39.46 
 
 
322 aa  235  7e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  36.66 
 
 
322 aa  228  8e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  39.46 
 
 
322 aa  226  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  38.13 
 
 
322 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  37.79 
 
 
322 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.80398e-12  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  37.94 
 
 
320 aa  221  2e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  38.16 
 
 
322 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  36.6 
 
 
322 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  37.54 
 
 
313 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  37.83 
 
 
322 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  36.22 
 
 
322 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  33.99 
 
 
331 aa  216  3e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  39.67 
 
 
323 aa  216  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  35.69 
 
 
322 aa  213  2e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  35.69 
 
 
322 aa  214  2e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  35.37 
 
 
322 aa  214  2e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  35.69 
 
 
322 aa  213  3e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  39.1 
 
 
322 aa  213  3e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  36.33 
 
 
330 aa  212  5e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  36.84 
 
 
322 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  36.84 
 
 
322 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  38.21 
 
 
322 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.9 
 
 
324 aa  211  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  36.98 
 
 
322 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.37 
 
 
322 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  33.76 
 
 
358 aa  210  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0752  trans-hexaprenyltranstransferase  36.16 
 
 
327 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0130726 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  36.7 
 
 
336 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  35.9 
 
 
334 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  36.51 
 
 
333 aa  206  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  4.46804e-07  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  35.81 
 
 
334 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  36.6 
 
 
336 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  35.9 
 
 
323 aa  206  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  7.77945e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  35.69 
 
 
344 aa  205  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  38.03 
 
 
322 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  36.03 
 
 
336 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  37.18 
 
 
323 aa  205  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  35.62 
 
 
337 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  34.08 
 
 
332 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  36.24 
 
 
336 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  36.42 
 
 
323 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  4.37093e-10  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.01 
 
 
345 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  35.91 
 
 
336 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  35.26 
 
 
332 aa  203  4e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  35.99 
 
 
323 aa  202  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.29591e-06  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  36.58 
 
 
331 aa  202  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  37.38 
 
 
323 aa  202  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.27512e-05  decreased coverage  5.00836e-06 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  37.62 
 
 
323 aa  202  9e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  36.51 
 
 
322 aa  201  1e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  35.03 
 
 
323 aa  201  1e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.39544e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  35.35 
 
 
323 aa  201  1e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  3.24786e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  35.46 
 
 
323 aa  201  1e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.59787e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  37 
 
 
336 aa  201  1e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  34.73 
 
 
328 aa  201  2e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  36.24 
 
 
336 aa  200  2e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130526 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  35.03 
 
 
323 aa  200  2e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  9.96752e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  35.03 
 
 
323 aa  200  2e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.5877e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.26 
 
 
322 aa  200  2e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  35.03 
 
 
323 aa  200  2e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.47788e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  35.03 
 
 
323 aa  200  2e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  34.94 
 
 
370 aa  200  2e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  34.94 
 
 
370 aa  200  2e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  5.67296e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  34.94 
 
 
370 aa  200  2e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  34.94 
 
 
370 aa  200  2e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  34.94 
 
 
370 aa  200  2e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  35.03 
 
 
323 aa  200  2e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  35.03 
 
 
323 aa  200  2e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  34.73 
 
 
356 aa  200  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  38.26 
 
 
323 aa  200  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.91483e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  32.13 
 
 
341 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  34.41 
 
 
322 aa  199  4e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  37.97 
 
 
333 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  34.85 
 
 
332 aa  199  5e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  9.26468e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  33.22 
 
 
337 aa  199  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  36.81 
 
 
342 aa  199  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  36.91 
 
 
331 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.03675e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  37.5 
 
 
359 aa  199  8e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  36.88 
 
 
324 aa  198  8e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  35.65 
 
 
324 aa  198  8e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  36.19 
 
 
331 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  3.09131e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  36.19 
 
 
331 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  5.87704e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  36.19 
 
 
331 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  2.53104e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  33.12 
 
 
360 aa  198  1e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  39.68 
 
 
321 aa  198  1e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.04163e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  34.56 
 
 
339 aa  198  1e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  35.13 
 
 
323 aa  198  1e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  6.12724e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  34.34 
 
 
340 aa  198  1e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  34.34 
 
 
340 aa  197  2e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  33.55 
 
 
335 aa  197  2e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  37.3 
 
 
323 aa  197  2e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  6.84066e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  37.63 
 
 
333 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  37.63 
 
 
333 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  35.02 
 
 
351 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  34.41 
 
 
340 aa  196  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  35.26 
 
 
327 aa  196  4e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  36.66 
 
 
343 aa  196  4e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  34.41 
 
 
338 aa  196  4e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>