More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1562 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1562  transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  324  3e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1749  MerR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 241 aa  137  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.682518  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  33.81 
 
 		 247 aa  88.6  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  31.51 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 252 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1599  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  34.29 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  33.65 
 
 		 395 aa  68.2  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 215 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 214 aa  67.4  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 304 aa  67  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2061  MerR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 238 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 253 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  29.41 
 
 		 259 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 215 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  40.58 
 
 		 258 aa  67  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  37.14 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  49.25 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2583  regulatory protein MerR  36.43 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2141  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0481912  normal  0.077667 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2531  MerR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00201177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  41.27 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 251 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  32.39 
 
 		 244 aa  64.3  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  30.36 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 256 aa  64.3  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0275  transcriptional regulator, MerR family  43.06 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.524855  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  32.08 
 
 		 254 aa  63.9  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  39.51 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  28.06 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  39.51 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  38.27 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  32.14 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  42.03 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  46.97 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  46.97 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  46.97 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  46.97 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 648 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  46.97 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  46.97 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  31.73 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  46.97 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  46.97 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  46.97 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  40.3 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  32.32 
 
 		 284 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  39.47 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 268 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  39.47 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  36.78 
 
 		 254 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  39.47 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0525  putative transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178502 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  39.47 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 288 aa  61.2  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  31.19 
 
 		 255 aa  60.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 254 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  39.47 
 
 		 243 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  40.58 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 241 aa  60.8  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 276 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0877  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  34.34 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0837  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  35.58 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  42.42 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  34.12 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  42.42 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0931  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1107  transcriptional regulator, MerR family  42.03 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  35.58 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  42.42 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  35.58 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1021  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10693e-29 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0829  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3724  zinc-responsive transcriptional regulator  42.42 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>