95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0834 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0834  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  188  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1327  hypothetical protein  87.23 
 
 		 94 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1353  hypothetical protein  87.23 
 
 		 94 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  43.18 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2467  hypothetical protein  45.95 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893193  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0697  hypothetical protein  49.41 
 
 		 100 aa  81.6  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  47.78 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3913  hypothetical protein  47.3 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3666  hypothetical protein  47.3 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000614384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3556  hypothetical protein  47.3 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000244888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3574  hypothetical protein  47.3 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000033301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3827  hypothetical protein  47.3 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33695e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3952  hypothetical protein  47.3 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000117603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3862  hypothetical protein  47.3 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000195024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3853  hypothetical protein  47.3 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000207203  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  39.77 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3637  hypothetical protein  45.95 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000118018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  45.95 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0812  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  42.55 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00180555  hitchhiker  0.00771974 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0455  protein of unknown function DUF448  50 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1660  hypothetical protein  51.25 
 
 		 88 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  40.66 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0431  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  42.86 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.219386  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1942  hypothetical protein  51.25 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0815  hypothetical protein  58 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.183473  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  43.75 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0381  hypothetical protein  40.96 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1433  protein of unknown function DUF448  43.66 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00060627  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0379  hypothetical protein  39.76 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1357  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  43.75 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0924  hypothetical protein  41.38 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000861315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  40.22 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  46.38 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3678  protein of unknown function DUF448  47.46 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000159696  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  44.93 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl293  hypothetical protein  39.76 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0458979  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1959  hypothetical protein  40.58 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  35.29 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  36.59 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  29.07 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1207  protein of unknown function DUF448  42.86 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602769  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  32.89 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  40 
 
 		 212 aa  53.5  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  32.47 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  32.26 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  33.9 
 
 		 252 aa  51.6  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0232  hypothetical protein  37.31 
 
 		 264 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  37.31 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1442  protein of unknown function DUF448  48.98 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0162227  normal  0.205781 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2756  hypothetical protein  37.7 
 
 		 202 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.014789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0335  hypothetical protein  34.94 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0599  hypothetical protein  37.31 
 
 		 275 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0911  protein of unknown function DUF448  34.72 
 
 		 100 aa  50.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  36.07 
 
 		 210 aa  50.1  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  40 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1474  protein of unknown function DUF448  38.46 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00145328  unclonable  0.00000273772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0030  hypothetical protein  37.7 
 
 		 221 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0875  hypothetical protein  33.9 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00646034  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  35.71 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2593  hypothetical protein  30.99 
 
 		 206 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0056  hypothetical protein  28.89 
 
 		 237 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3627  hypothetical protein  43.14 
 
 		 227 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426525 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0294  hypothetical protein  30.59 
 
 		 239 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.211719  decreased coverage  0.00732343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3817  hypothetical protein  35.71 
 
 		 246 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.429858  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2612  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150488  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  35.23 
 
 		 205 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2491  hypothetical protein  32.86 
 
 		 244 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00369583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  27.59 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0023  hypothetical protein  34.43 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  0.0323771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  26.39 
 
 		 243 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1164  hypothetical protein  32.79 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0441  hypothetical protein  32.1 
 
 		 259 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2825  hypothetical protein  32.79 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08050  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  37.74 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.241726  normal  0.0903759 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  29.17 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  29.17 
 
 		 197 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  26.32 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  27.78 
 
 		 247 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  27.78 
 
 		 247 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  31.82 
 
 		 234 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1050  protein of unknown function DUF448  40 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103013  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31832  predicted protein  35.06 
 
 		 317 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.485373 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  27.78 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  28.74 
 
 		 203 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  31.25 
 
 		 95 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  34.92 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3780  hypothetical protein  28.79 
 
 		 263 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0777  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  30.99 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.894427  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1253  hypothetical protein  32.79 
 
 		 211 aa  40.8  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf786  putative transcription termination factor  29.17 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0771  hypothetical protein  31.82 
 
 		 193 aa  40.4  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3728  hypothetical protein  30.3 
 
 		 240 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  normal  0.0153677 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1811  protein of unknown function DUF448  27.54 
 
 		 95 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.391163  normal  0.635855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>