15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0771 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0771  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  371  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2317  protein of unknown function DUF448  37.08 
 
 
179 aa  105  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000982991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  26.6 
 
 
197 aa  55.1  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  26.6 
 
 
197 aa  55.1  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_004310  BR2164  hypothetical protein  35.71 
 
 
200 aa  45.1  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  26.28 
 
 
205 aa  45.1  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  21.71 
 
 
240 aa  45.1  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2076  hypothetical protein  35.71 
 
 
217 aa  44.7  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  27.59 
 
 
108 aa  44.7  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  26.09 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0748  hypothetical protein  35.71 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213653  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  34 
 
 
247 aa  43.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  28.24 
 
 
93 aa  42  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4388  hypothetical protein  27.54 
 
 
230 aa  41.6  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.693571 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  25.88 
 
 
95 aa  41.2  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>