More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0177 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  100 
 
 		 182 aa  365  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  96.7 
 
 		 182 aa  356  9e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  96.7 
 
 		 182 aa  356  9e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  68.57 
 
 		 177 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  68 
 
 		 177 aa  237  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  61.14 
 
 		 181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  64 
 
 		 175 aa  230  8.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  58.29 
 
 		 180 aa  225  2e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  63.07 
 
 		 175 aa  223  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  66.29 
 
 		 177 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  66.29 
 
 		 177 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  66.29 
 
 		 177 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  66.29 
 
 		 177 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  66.29 
 
 		 177 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  66.29 
 
 		 177 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  66.29 
 
 		 177 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  66.29 
 
 		 177 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  57.87 
 
 		 175 aa  218  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  66.86 
 
 		 177 aa  217  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  66.29 
 
 		 177 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  60.8 
 
 		 175 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0268  transcription antitermination protein nusG  55.08 
 
 		 192 aa  213  9.999999999999999e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000582831  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  59.2 
 
 		 203 aa  209  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  57.71 
 
 		 174 aa  209  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  57.39 
 
 		 178 aa  209  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  58.29 
 
 		 176 aa  204  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  60.57 
 
 		 175 aa  204  8e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  56.14 
 
 		 188 aa  201  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1422  transcription antitermination protein nusG  54.89 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.002098  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  53.63 
 
 		 183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  52.49 
 
 		 187 aa  195  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  57.69 
 
 		 172 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  53.14 
 
 		 194 aa  192  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  57.47 
 
 		 177 aa  191  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  52 
 
 		 194 aa  191  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  55.17 
 
 		 173 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  55.17 
 
 		 173 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  54.95 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  53.37 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  52.81 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  53.37 
 
 		 177 aa  184  8e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  49.44 
 
 		 181 aa  180  8.000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0263  transcription antitermination protein NusG  52.57 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000027375  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  50.57 
 
 		 201 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  48.39 
 
 		 266 aa  177  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2062  transcription antitermination protein NusG  51.43 
 
 		 179 aa  175  4e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  49.15 
 
 		 273 aa  174  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  47.87 
 
 		 280 aa  174  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  49.15 
 
 		 277 aa  174  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  44.44 
 
 		 306 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  47.75 
 
 		 243 aa  171  5e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  46.96 
 
 		 266 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  45.08 
 
 		 272 aa  170  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  44.1 
 
 		 266 aa  170  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  44.68 
 
 		 272 aa  170  9e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  44.16 
 
 		 276 aa  170  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  48.35 
 
 		 238 aa  169  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  49.44 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  48.89 
 
 		 178 aa  169  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2406  transcription antitermination protein NusG  50.29 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337578  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2954  NusG antitermination factor  43.23 
 
 		 198 aa  167  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000249386  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  44.56 
 
 		 238 aa  167  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  48.33 
 
 		 178 aa  167  7e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  50.83 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  44.33 
 
 		 270 aa  167  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  44.33 
 
 		 270 aa  167  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  44.33 
 
 		 271 aa  167  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  43.81 
 
 		 299 aa  167  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1532  NusG antitermination factor  48.57 
 
 		 174 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  49.12 
 
 		 172 aa  166  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  47.8 
 
 		 250 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  45.86 
 
 		 242 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  45.86 
 
 		 242 aa  165  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  44.74 
 
 		 267 aa  164  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  45.9 
 
 		 246 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  46.07 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  46.07 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  48.6 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  46.59 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  47.13 
 
 		 173 aa  162  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  45.51 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  47.46 
 
 		 177 aa  161  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  44.51 
 
 		 190 aa  161  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273158  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  44.75 
 
 		 190 aa  160  7e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  46.96 
 
 		 228 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  44.94 
 
 		 185 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  44.94 
 
 		 185 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  44.94 
 
 		 185 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  45.2 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  44.94 
 
 		 185 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  44.94 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  45.2 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  44.94 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  44.94 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  44.94 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  44.94 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  44.94 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  44.94 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  44.94 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  44.94 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>