More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0069 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  100 
 
 
101 aa  192  9e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  96.04 
 
 
101 aa  186  8e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  4.985e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  83.17 
 
 
101 aa  167  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  2.23185e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  67.65 
 
 
103 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  65.69 
 
 
103 aa  134  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  67.65 
 
 
103 aa  129  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.83187e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  66.67 
 
 
103 aa  129  1e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.09018e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  66.67 
 
 
103 aa  129  1e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  6.03774e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  66.67 
 
 
103 aa  129  1e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.27512e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  66.67 
 
 
103 aa  129  1e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  5.45325e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  66.67 
 
 
103 aa  129  1e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.77787e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  66.67 
 
 
103 aa  129  1e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.07051e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  66.67 
 
 
103 aa  129  1e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.11062e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  66.67 
 
 
103 aa  129  1e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.36575e-10  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  66.67 
 
 
103 aa  129  1e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  67.65 
 
 
103 aa  128  2e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.84056e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  63.37 
 
 
102 aa  122  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  65.66 
 
 
105 aa  119  2e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  65.66 
 
 
105 aa  119  2e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  62.14 
 
 
106 aa  118  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  58.82 
 
 
102 aa  117  6e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  7.19742e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  65.66 
 
 
105 aa  116  9e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  60.19 
 
 
106 aa  105  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  1.32884e-06  hitchhiker  1.26153e-07 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  53.06 
 
 
104 aa  105  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 
105 aa  103  8e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  7.17269e-06 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  51.52 
 
 
102 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 
106 aa  102  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  50.47 
 
 
118 aa  102  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  53.54 
 
 
105 aa  101  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  54 
 
 
106 aa  100  7e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  50.51 
 
 
102 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 
104 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 
107 aa  98.6  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  56.44 
 
 
122 aa  97.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  47.47 
 
 
102 aa  97.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 
105 aa  97.4  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.35301e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 
105 aa  97.4  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 
117 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  1.92817e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 
104 aa  96.3  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  5.30898e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  49.51 
 
 
107 aa  95.9  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 
104 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 
119 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  56.86 
 
 
105 aa  94.7  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  3.01536e-07  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2221  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 
113 aa  94.4  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2570  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 
115 aa  94.4  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949988  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 
106 aa  94  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.32797e-05  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  51.02 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 
104 aa  93.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  48.51 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 
104 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  55.88 
 
 
105 aa  92  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  52.53 
 
 
104 aa  92.8  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  47.52 
 
 
105 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 
105 aa  92.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  56.57 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  46 
 
 
104 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  46 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
104 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  51 
 
 
105 aa  91.3  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  47.57 
 
 
104 aa  91.3  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  59.41 
 
 
106 aa  91.3  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  45 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 
103 aa  90.5  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  50.98 
 
 
106 aa  90.5  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 
115 aa  90.5  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  47.47 
 
 
105 aa  90.5  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  46 
 
 
103 aa  90.5  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 
104 aa  90.1  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4354  ribosomal protein L24  49.02 
 
 
113 aa  90.1  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  2.83369e-10  normal  0.0433971 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  45 
 
 
104 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0770  50S ribosomal protein L24  47.96 
 
 
101 aa  90.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  0.799575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 
108 aa  89.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  62.5 
 
 
89 aa  90.1  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  1.25199e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 
103 aa  89.4  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  7.81328e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  47 
 
 
103 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  45 
 
 
104 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1966  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  46.6 
 
 
103 aa  89.4  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  2.82756e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 
106 aa  89.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  52 
 
 
104 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0365  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 
118 aa  90.1  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.889516  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  53.54 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 
106 aa  89  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 
104 aa  89  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  5.85684e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 
105 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0260  50S ribosomal protein L24  52 
 
 
102 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0016412  hitchhiker  0.00832042 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0207  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 
104 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.41259e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1847  ribosomal protein L24  51.52 
 
 
113 aa  88.2  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.09549e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4159  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 
104 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.35344e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0181  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 
104 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.29578e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0211  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 
104 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.51512e-07  unclonable  8.02476e-06 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  53.47 
 
 
112 aa  88.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  3.39235e-05  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  56 
 
 
104 aa  88.6  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 
108 aa  88.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4045  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 
104 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.15284e-07  unclonable  3.47385e-12 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 
105 aa  87.8  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  7.60345e-07  unclonable  2.81859e-10 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0242  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 
104 aa  87.8  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>