234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0039 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0039  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  946    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17370  hypothetical protein  36.84 
 
 		 552 aa  229  7e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0800507  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  35.08 
 
 		 476 aa  229  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  34.1 
 
 		 480 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0647  protein of unknown function DUF404  32.92 
 
 		 482 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  34.45 
 
 		 476 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2256  protein of unknown function DUF404  34.45 
 
 		 488 aa  224  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4767  protein of unknown function DUF404  33.05 
 
 		 476 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522972 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2415  hypothetical protein  34.67 
 
 		 463 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0823  hypothetical protein  35.79 
 
 		 470 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1078  hypothetical protein  34.67 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0733  protein of unknown function DUF404  32.18 
 
 		 482 aa  217  4e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1493  protein of unknown function DUF404  32.14 
 
 		 501 aa  215  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0051317  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3876  protein of unknown function DUF404  34.45 
 
 		 476 aa  215  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0231  protein of unknown function DUF404  32.63 
 
 		 501 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5079  hypothetical protein  36.32 
 
 		 489 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.921334  normal  0.0721904 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1567  hypothetical protein  34.53 
 
 		 472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.188349 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  33.06 
 
 		 488 aa  213  4.9999999999999996e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  31.51 
 
 		 482 aa  213  9e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2522  protein of unknown function DUF404  36.34 
 
 		 487 aa  211  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 488 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2905  hypothetical protein  36.34 
 
 		 487 aa  211  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  32.91 
 
 		 518 aa  209  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0391  hypothetical protein  33.4 
 
 		 473 aa  210  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  35.38 
 
 		 861 aa  209  8e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  33.33 
 
 		 489 aa  209  8e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3035  hypothetical protein  32.01 
 
 		 486 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3157  hypothetical protein  32.71 
 
 		 472 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2264  hypothetical protein  33.54 
 
 		 502 aa  207  3e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3462  hypothetical protein  30.4 
 
 		 488 aa  207  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0178191 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0540  hypothetical protein  33.19 
 
 		 492 aa  207  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.916398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5273  hypothetical protein  32.92 
 
 		 472 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1353  hypothetical protein  34.12 
 
 		 518 aa  206  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0247151 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11421  hypothetical protein  31.67 
 
 		 480 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  32.91 
 
 		 520 aa  206  9e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0733  hypothetical protein  32.29 
 
 		 476 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.195741  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1676  protein of unknown function DUF404  31.1 
 
 		 482 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  31.39 
 
 		 482 aa  205  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  29.92 
 
 		 482 aa  205  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1427  hypothetical protein  32.85 
 
 		 470 aa  206  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11431  hypothetical protein  31.67 
 
 		 480 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1742  hypothetical protein  30.88 
 
 		 482 aa  205  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.208956  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0308  hypothetical protein  32.08 
 
 		 488 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.660093  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1049  hypothetical protein  31.67 
 
 		 480 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4768  protein of unknown function DUF404  32.01 
 
 		 480 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  31.7 
 
 		 477 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  32.7 
 
 		 489 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2607  hypothetical protein  34.36 
 
 		 477 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2474  hypothetical protein  35.6 
 
 		 515 aa  203  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813576  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  32.7 
 
 		 472 aa  203  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3403  protein of unknown function DUF404  34.6 
 
 		 497 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3021  hypothetical protein  32.45 
 
 		 487 aa  202  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262026  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2775  hypothetical protein  31.79 
 
 		 477 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1047  hypothetical protein  32.36 
 
 		 491 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100959  normal  0.237533 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0404  hypothetical protein  33.65 
 
 		 485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3524  hypothetical protein  30.67 
 
 		 470 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  32.77 
 
 		 472 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  31.93 
 
 		 486 aa  200  5e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3166  protein of unknown function DUF404  30.46 
 
 		 469 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.839276  normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3157  hypothetical protein  34.04 
 
 		 498 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1922  u1937b; B1937_F1_4  31.03 
 
 		 471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2676  hypothetical protein  33.57 
 
 		 475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.508929 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1913  protein of unknown function DUF404  32.15 
 
 		 480 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1213  protein of unknown function DUF404  32.77 
 
 		 553 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15711  hypothetical protein  31.98 
 
 		 477 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.144096 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1781  hypothetical protein  30.98 
 
 		 471 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2799  protein of unknown function DUF404  31.85 
 
 		 553 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.991145  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2052  hypothetical protein  30.98 
 
 		 471 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1063  protein of unknown function DUF404  30.11 
 
 		 482 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.911809  normal  0.0320136 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3101  hypothetical protein  31.03 
 
 		 481 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2041  hypothetical protein  30.98 
 
 		 477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00170326  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0773  hypothetical protein  31.03 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2550  hypothetical protein  34.27 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0250642  normal  0.761485 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1066  hypothetical protein  31.03 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1937  protein of unknown function DUF404  31.73 
 
 		 480 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0674  hypothetical protein  30.98 
 
 		 477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1060  protein of unknown function DUF404  34.44 
 
 		 494 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0964  protein of unknown function DUF404  34.44 
 
 		 494 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0374864 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1206  hypothetical protein  34.04 
 
 		 518 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0765  hypothetical protein  30.98 
 
 		 478 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2198  hypothetical protein  32.29 
 
 		 507 aa  197  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.738171  normal  0.508584 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3437  hypothetical protein  30.64 
 
 		 464 aa  197  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0006  hypothetical protein  32.38 
 
 		 470 aa  197  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.377329 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3519  hypothetical protein  31.63 
 
 		 476 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2050  protein of unknown function DUF404  32.98 
 
 		 497 aa  197  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1083  hypothetical protein  34.2 
 
 		 490 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0990  hypothetical protein  31.25 
 
 		 484 aa  196  7e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2901  protein of unknown function DUF404  30.25 
 
 		 469 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00642999  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1020  hypothetical protein  33.88 
 
 		 487 aa  196  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667144  normal  0.926165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0934  protein of unknown function DUF404  33.57 
 
 		 487 aa  195  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.411531  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2164  protein of unknown function DUF404  31.56 
 
 		 479 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3106  hypothetical protein  33.06 
 
 		 469 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3574  protein of unknown function DUF404  32.85 
 
 		 479 aa  195  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2688  hypothetical protein  33.06 
 
 		 469 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1121  hypothetical protein  34.2 
 
 		 507 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4482  hypothetical protein  30.17 
 
 		 469 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1940  hypothetical protein  32.51 
 
 		 472 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.808234 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1936  hypothetical protein  31.05 
 
 		 476 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881326  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2636  hypothetical protein  31.91 
 
 		 499 aa  194  4e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  34.38 
 
 		 865 aa  193  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>