69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0759 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  893    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  62.7 
 
 
469 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  62.24 
 
 
469 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  47.4 
 
 
466 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  48.42 
 
 
444 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  41.53 
 
 
442 aa  310  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  36.71 
 
 
445 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.7 
 
 
453 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  33.11 
 
 
455 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  39.69 
 
 
462 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  36.2 
 
 
474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  36.09 
 
 
465 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.39 
 
 
475 aa  232  9e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  38.28 
 
 
473 aa  229  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  36.66 
 
 
471 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.41 
 
 
481 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  35.08 
 
 
470 aa  213  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  36.47 
 
 
460 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  33.11 
 
 
473 aa  203  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  34.06 
 
 
471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  36.5 
 
 
460 aa  201  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  36.5 
 
 
460 aa  201  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  33.55 
 
 
467 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  32.47 
 
 
474 aa  197  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.34 
 
 
455 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  35.23 
 
 
445 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  33.12 
 
 
467 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  33.33 
 
 
453 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  33.18 
 
 
456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  33.33 
 
 
464 aa  186  7e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  35.24 
 
 
468 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.44 
 
 
443 aa  183  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  32.4 
 
 
466 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  32.4 
 
 
466 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  32.4 
 
 
466 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  32.4 
 
 
466 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  32.4 
 
 
466 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  32.4 
 
 
466 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  32.68 
 
 
470 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  30.63 
 
 
479 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.77 
 
 
883 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  32.09 
 
 
454 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 
485 aa  169  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  30.88 
 
 
482 aa  169  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 
523 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 
480 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  31.02 
 
 
478 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 
478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  28.95 
 
 
468 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  28.64 
 
 
466 aa  146  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  29.4 
 
 
468 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  27.27 
 
 
499 aa  137  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  34.25 
 
 
1751 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  27.15 
 
 
458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  20.62 
 
 
506 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  26.14 
 
 
490 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2673  hypothetical protein  27.4 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4223  hypothetical protein  37.93 
 
 
125 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284789  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  27 
 
 
507 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  30.63 
 
 
477 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5301  hypothetical protein  44.93 
 
 
303 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.730903  normal  0.0168693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3372  hypothetical protein  40.24 
 
 
239 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 
479 aa  53.9  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  28.62 
 
 
633 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  23.11 
 
 
572 aa  50.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.66 
 
 
608 aa  46.6  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  18.55 
 
 
500 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  18.55 
 
 
500 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1406  thioredoxin reductase  32.35 
 
 
638 aa  44.7  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>