82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3337 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3337  ribonuclease P protein  100 
 
 		 174 aa  342  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  47.83 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  47.83 
 
 		 137 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  47.83 
 
 		 137 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  48.18 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  42.74 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  51.69 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  43.86 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  41.74 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  54.29 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  39.83 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  41.88 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  41.38 
 
 		 133 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  41.59 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  40.32 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  42.28 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  64.29 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  38.05 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  49.33 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0068  ribonuclease P protein component  40.83 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190277  decreased coverage  0.00398675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  46.48 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  39.47 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0684  ribonuclease P protein component  45 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  37.07 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  33.59 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0584  hypothetical protein  39.8 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000877288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0637  ribonuclease P protein component  43.22 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150092  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3075  ribonuclease P protein  43.33 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  37.17 
 
 		 240 aa  57  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  33.59 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  36.84 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3704  ribonuclease P protein component  43.59 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  36.84 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  36.84 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  36.84 
 
 		 119 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  36.84 
 
 		 119 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  36.84 
 
 		 119 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  36.84 
 
 		 119 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2139  ribonuclease P protein component  44.64 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0818  ribonuclease P protein component  52.11 
 
 		 95 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  36.84 
 
 		 119 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  36.84 
 
 		 115 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  42.53 
 
 		 93 aa  53.9  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  36.84 
 
 		 115 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  45.07 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0300  ribonuclease P protein component  47.57 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  36.84 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7325  ribonuclease P protein component  41.03 
 
 		 136 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 		 121 aa  52  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  35.14 
 
 		 115 aa  50.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  47.92 
 
 		 107 aa  48.9  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1829  ribonuclease P protein component  40.58 
 
 		 80 aa  48.1  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  39.13 
 
 		 111 aa  47.8  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1922  ribonuclease P protein component  46.38 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239501  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  36.49 
 
 		 111 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  40 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0375  ribonuclease P  43.86 
 
 		 120 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.174091  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  57.45 
 
 		 126 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  57.45 
 
 		 120 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2352  ribonuclease P protein component  44.07 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  42.35 
 
 		 136 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0857  ribonuclease P protein component  33.82 
 
 		 113 aa  45.1  0.0005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0552  ribonuclease P protein component  43.55 
 
 		 110 aa  44.7  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  46.15 
 
 		 121 aa  44.7  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  40.28 
 
 		 117 aa  44.7  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  37.31 
 
 		 79 aa  44.7  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2631  ribonuclease P protein component  44.35 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88975  normal  0.0705179 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  29.59 
 
 		 117 aa  44.3  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  53.19 
 
 		 126 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  34.21 
 
 		 120 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  40.58 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  35.38 
 
 		 116 aa  42.4  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  39.36 
 
 		 123 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  35.21 
 
 		 125 aa  42.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  35.21 
 
 		 125 aa  42.4  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  40.21 
 
 		 132 aa  42  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  48.08 
 
 		 132 aa  41.6  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2309  ribonuclease P protein component  42.24 
 
 		 169 aa  41.2  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  0.100774 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  33.93 
 
 		 110 aa  40.8  0.009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  34.83 
 
 		 116 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  42.31 
 
 		 116 aa  40.8  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  79.17 
 
 		 116 aa  40.8  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>