223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2764 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2764  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  1000    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.338805  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2232  RimK domain protein ATP-grasp  47.23 
 
 		 494 aa  430  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.360505 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0575  RimK domain protein ATP-grasp  46.91 
 
 		 490 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103875  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3347  hypothetical protein  44.72 
 
 		 495 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2617  hypothetical protein  43.9 
 
 		 524 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1892  RimK domain-containing protein ATP-grasp  45.93 
 
 		 502 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39390  ribosomal protein S6 modification enzyme  44.31 
 
 		 495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46880  glutathione synthase  44.06 
 
 		 529 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000272025 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4039  hypothetical protein  43.65 
 
 		 515 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0756389  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2526  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase  43.64 
 
 		 528 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000161005  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0776  RimK domain-containing protein ATP-grasp  43.04 
 
 		 486 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121233  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2466  hypothetical protein  43.29 
 
 		 518 aa  388  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2089  RimK domain protein ATP-grasp  43.29 
 
 		 518 aa  388  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2956  ribosomal protein S6 modification protein-related protein  43.97 
 
 		 526 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0238931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2716  RimK domain-containing protein ATP-grasp  44.51 
 
 		 526 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0957  RimK-like ATP-grasp  42.65 
 
 		 486 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1912  hypothetical protein  41.58 
 
 		 483 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1458  RimK domain-containing protein ATP-grasp  42.59 
 
 		 502 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0341602  normal  0.0124544 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1291  RimK domain-containing protein ATP-grasp  38.85 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.696817  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1157  glutathione synthase  37.99 
 
 		 483 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1841  RimK domain-containing protein ATP-grasp  39.29 
 
 		 492 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1035  RimK domain-containing protein ATP-grasp  39.96 
 
 		 499 aa  350  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.494403  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1453  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  40.59 
 
 		 490 aa  348  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5784  RimK domain protein ATP-grasp  39.35 
 
 		 486 aa  343  2.9999999999999997e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1722  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  41.76 
 
 		 499 aa  342  1e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02216  glutathione synthase  37.5 
 
 		 495 aa  342  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000592479  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2526  hypothetical protein  42.07 
 
 		 496 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2915  glutathione synthase  38.99 
 
 		 486 aa  335  9e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4158  RimK-like ATP-grasp  37.73 
 
 		 488 aa  325  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.530195  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0446  hypothetical protein  36.17 
 
 		 484 aa  322  8e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0422  hypothetical protein  36.17 
 
 		 484 aa  322  8e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1695  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.72 
 
 		 335 aa  168  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.803385  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0475  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.21 
 
 		 316 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.60167  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1433  RimK domain-containing protein ATP-grasp  33.21 
 
 		 316 aa  166  8e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1626  RimK domain-containing protein ATP-grasp  37.07 
 
 		 290 aa  160  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0205048 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1421  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31.5 
 
 		 316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1201  RimK domain-containing protein ATP-grasp  37.2 
 
 		 255 aa  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.12 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2545  RimK domain protein ATP-grasp  31.37 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19362  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.13 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.67 
 
 		 294 aa  73.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.88 
 
 		 296 aa  72  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  29.53 
 
 		 283 aa  69.3  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.33 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  26.43 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  26.43 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  28.09 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  27.07 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.43 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  26.43 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.17 
 
 		 282 aa  66.2  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  29.44 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.21 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  26.21 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  26.21 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  26.21 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  26.98 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  26.67 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  27.16 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  24.3 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  24.3 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.25 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.25 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.25 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  25.83 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  26.12 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  26.69 
 
 		 301 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  25.42 
 
 		 301 aa  63.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  25.91 
 
 		 301 aa  63.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  26.79 
 
 		 302 aa  62.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  26.67 
 
 		 286 aa  62.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  27.24 
 
 		 301 aa  62.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.84 
 
 		 283 aa  63.2  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.69 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.15 
 
 		 281 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  27.2 
 
 		 301 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  29.32 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  27.27 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  24.59 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.99 
 
 		 301 aa  62.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.33 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  27.23 
 
 		 301 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  26.69 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  26.69 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  26.09 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.25 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  25.6 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  26.09 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1212  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  27.75 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0387338  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  25.7 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  25.7 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2640  S6 modification enzyme RimK  26.67 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.363149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  27.16 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  27.16 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  27.82 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  24.75 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  26.75 
 
 		 301 aa  59.3  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  27.64 
 
 		 301 aa  59.7  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  26.45 
 
 		 301 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  25.65 
 
 		 301 aa  60.1  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>