217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3245 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  100 
 
 		 95 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  90.53 
 
 		 95 aa  177  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  76.84 
 
 		 95 aa  141  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  52 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3029  acylphosphatase  49.43 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14564  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  58.21 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  53.49 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  51.28 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  50.51 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  48 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6189  acylphosphatase  51.43 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0219  putative acylphosphatase protein  46.07 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1185  acylphosphatase  47.87 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  48.91 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  43.02 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  53.42 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1584  acylphosphatase  47.06 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0085  acylphosphatase  45.65 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.49451 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  45.45 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0787  acylphosphatase  42.39 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  46.74 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1453  acylphosphatase  44.19 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  43.18 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  46.59 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  45.45 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4846  acylphosphatase  44.87 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  45.78 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  41.76 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  41.38 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  41.05 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3795  acylphosphatase  53.52 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.524231 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2447  acylphosphatase  45.74 
 
 		 92 aa  66.6  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  45.74 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0736  acylphosphatase  42.39 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  50.75 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0745  acylphosphatase  46.97 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  45.65 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  47.3 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  43.68 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3384  acylphosphatase  41.38 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  41.76 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4198  acylphosphatase  45.98 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0019532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  41.76 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0300  acylphosphatase  41.3 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  45.65 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  43.68 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  46.07 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  41.67 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  46.74 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  46.58 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  45.45 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  44 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  40.86 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  51.35 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  45.83 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  45.83 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  40.74 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  43.62 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  41.67 
 
 		 94 aa  62  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  41.3 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  43.24 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4339  acylphosphatase  47.3 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0201054  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  45.21 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  45.35 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  47.14 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1322  acylphosphatase  48.68 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0315179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  43.33 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1716  acylphosphatase  40.79 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000101765  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  41.94 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  41.18 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  43.33 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  40.23 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0862  acylphosphatase  41.38 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2248  acylphosphatase  42.65 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.946619  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  40.22 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2095  acylphosphatase  40.3 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.451224  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  44.29 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  40.23 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  40.23 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  40.23 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  40.23 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  47.69 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1921  acylphosphatase  43.68 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1812  acylphosphatase  41.67 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0496  acylphosphatase  47.5 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  40.48 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  38.57 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0091  acylphosphatase  40.3 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.104703  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1328  acylphosphatase  36.05 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0255  acylphosphatase  40 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.714232 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0099  acylphosphatase  40.7 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.643538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  42.39 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2746  acylphosphatase  41.76 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352229  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  44.83 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  46.27 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  40.22 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  36.9 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0103  acylphosphatase  36.05 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00111331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  34.88 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1216  acylphosphatase  38.95 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>