More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0296 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  58.64 
 
 		 661 aa  665    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  59.16 
 
 		 680 aa  691    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  92.56 
 
 		 659 aa  1169    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  66.36 
 
 		 667 aa  827    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  67.63 
 
 		 669 aa  816    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  97.72 
 
 		 659 aa  1207    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  56.34 
 
 		 652 aa  687    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  76.22 
 
 		 659 aa  1004    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  67.63 
 
 		 669 aa  822    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  67.48 
 
 		 663 aa  812    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  67.33 
 
 		 668 aa  847    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  67.63 
 
 		 669 aa  816    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  56.6 
 
 		 661 aa  677    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  67.02 
 
 		 663 aa  810    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  57.98 
 
 		 661 aa  636    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  59.66 
 
 		 665 aa  671    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 659 aa  1292    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  67.33 
 
 		 668 aa  841    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  55.73 
 
 		 656 aa  677    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  58.36 
 
 		 661 aa  665    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  59.01 
 
 		 664 aa  690    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  67.28 
 
 		 666 aa  829    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  65.2 
 
 		 660 aa  842    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  66.62 
 
 		 670 aa  825    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  76.52 
 
 		 674 aa  1001    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  67.63 
 
 		 669 aa  816    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  67.33 
 
 		 668 aa  842    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  56.69 
 
 		 655 aa  641    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  67.23 
 
 		 678 aa  841    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  67.63 
 
 		 669 aa  816    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  66.82 
 
 		 667 aa  834    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  66.77 
 
 		 670 aa  827    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  67.63 
 
 		 669 aa  816    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  67.33 
 
 		 668 aa  842    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  64.55 
 
 		 660 aa  846    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  57.39 
 
 		 661 aa  625  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  56.35 
 
 		 658 aa  613  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3491  potassium efflux system protein  57.7 
 
 		 661 aa  608  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  49.77 
 
 		 661 aa  559  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  49.77 
 
 		 661 aa  559  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  45.29 
 
 		 654 aa  478  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  38.72 
 
 		 662 aa  460  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  40.97 
 
 		 648 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  39.79 
 
 		 650 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  40.82 
 
 		 648 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  40.97 
 
 		 648 aa  439  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  41.75 
 
 		 648 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  38.89 
 
 		 654 aa  435  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  40.79 
 
 		 666 aa  433  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  40.7 
 
 		 649 aa  431  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  41.3 
 
 		 648 aa  432  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  40.97 
 
 		 648 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  41.75 
 
 		 648 aa  429  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  41.75 
 
 		 648 aa  429  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  39.73 
 
 		 649 aa  423  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  41.73 
 
 		 653 aa  420  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  39.06 
 
 		 657 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  40.19 
 
 		 655 aa  418  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  41.42 
 
 		 648 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  38.66 
 
 		 720 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  40.12 
 
 		 649 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  39.63 
 
 		 649 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3967  Sodium/hydrogen exchanger  45.57 
 
 		 570 aa  382  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  34.72 
 
 		 762 aa  339  9e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  34.61 
 
 		 775 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  34.51 
 
 		 658 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  37.3 
 
 		 583 aa  320  5e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  40.18 
 
 		 574 aa  318  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  38.83 
 
 		 591 aa  316  8e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  33.79 
 
 		 666 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.97 
 
 		 579 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.89 
 
 		 697 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  33.58 
 
 		 672 aa  311  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  33.8 
 
 		 771 aa  306  9.000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  32.15 
 
 		 674 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  32.93 
 
 		 773 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  34.39 
 
 		 572 aa  304  4.0000000000000003e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2952  Sodium/hydrogen exchanger, TrkA-N  38.02 
 
 		 568 aa  302  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  33.38 
 
 		 670 aa  297  4e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  35.99 
 
 		 665 aa  297  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  34.36 
 
 		 652 aa  297  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  37.16 
 
 		 593 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  33.59 
 
 		 688 aa  293  7e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  32.5 
 
 		 666 aa  292  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  36.46 
 
 		 693 aa  291  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  31.07 
 
 		 666 aa  291  3e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  32.61 
 
 		 665 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  32.61 
 
 		 665 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  31.32 
 
 		 665 aa  290  6e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  39.58 
 
 		 594 aa  288  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  32.23 
 
 		 656 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  36.89 
 
 		 533 aa  287  4e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0885  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  33.63 
 
 		 578 aa  286  7e-76  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  30.93 
 
 		 664 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  30.08 
 
 		 671 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  32.92 
 
 		 671 aa  282  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  33.63 
 
 		 664 aa  281  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0095  TrkA-N  34.09 
 
 		 569 aa  281  2e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2280  sodium/hydrogen exchanger  39.89 
 
 		 590 aa  282  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  34.59 
 
 		 666 aa  281  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>