More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4321 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  91.38 
 
 		 233 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  89.27 
 
 		 233 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  83.69 
 
 		 233 aa  397  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  82.02 
 
 		 230 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  80.43 
 
 		 230 aa  377  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  77.83 
 
 		 230 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  64.44 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  64.44 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  61.5 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  54.71 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  63.56 
 
 		 243 aa  256  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  54.55 
 
 		 250 aa  249  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  65.04 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3469  xanthine dehydrogenase accessory factor  61.46 
 
 		 233 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1293  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  55.71 
 
 		 235 aa  241  6e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126009  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1482  xanthine dehydrogenase accessory factor  51.57 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0236654 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  51.58 
 
 		 340 aa  205  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  59.17 
 
 		 376 aa  204  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  48.89 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  49.33 
 
 		 342 aa  201  8e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6028  hypothetical protein  48.43 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  50.23 
 
 		 323 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  50 
 
 		 388 aa  194  9e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  49.5 
 
 		 318 aa  191  7e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  55.62 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  53.01 
 
 		 329 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  51.09 
 
 		 323 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  53.11 
 
 		 176 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  54.78 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0970  hypothetical protein  48.59 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  45.45 
 
 		 306 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  51.53 
 
 		 356 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  43.72 
 
 		 306 aa  158  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  46.67 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  51.9 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  51.27 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  46.77 
 
 		 372 aa  147  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  50.31 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  41.46 
 
 		 340 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  42.62 
 
 		 386 aa  141  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  41.55 
 
 		 373 aa  141  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  41.1 
 
 		 340 aa  141  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  40.99 
 
 		 340 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  39.42 
 
 		 374 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  44.44 
 
 		 357 aa  135  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  43.71 
 
 		 326 aa  134  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  43.12 
 
 		 425 aa  134  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  36.87 
 
 		 366 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  41.72 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  39.05 
 
 		 368 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  44.17 
 
 		 370 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  40.3 
 
 		 372 aa  132  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  39.75 
 
 		 345 aa  131  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  41.1 
 
 		 343 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  41.1 
 
 		 343 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  40.49 
 
 		 453 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  41.1 
 
 		 339 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  42.77 
 
 		 329 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  41.1 
 
 		 341 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  38.3 
 
 		 368 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  36.14 
 
 		 380 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  40.85 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  41.1 
 
 		 338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  43.53 
 
 		 340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  37.44 
 
 		 356 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  44 
 
 		 319 aa  129  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  38.89 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  42.39 
 
 		 390 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  41.1 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  42.5 
 
 		 389 aa  128  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  41.94 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  43.71 
 
 		 312 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  41.94 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  42.6 
 
 		 389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  42.86 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  45.12 
 
 		 381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  38.89 
 
 		 385 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  42.24 
 
 		 342 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  37.8 
 
 		 373 aa  125  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  40.85 
 
 		 342 aa  124  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  38.25 
 
 		 385 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2391  hypothetical protein  41.32 
 
 		 322 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0816384  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  38.33 
 
 		 386 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  38.04 
 
 		 397 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  38.33 
 
 		 386 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  38.33 
 
 		 386 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  40.49 
 
 		 333 aa  121  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  40.38 
 
 		 367 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  40.99 
 
 		 341 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  41.61 
 
 		 341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  45.62 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  40.37 
 
 		 341 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  40.37 
 
 		 341 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  40.99 
 
 		 341 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  40.37 
 
 		 341 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  39.74 
 
 		 327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  40.46 
 
 		 357 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  41.38 
 
 		 369 aa  118  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  39.87 
 
 		 483 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>