More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2700 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 		 229 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  78.76 
 
 		 234 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  73.21 
 
 		 233 aa  331  6e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  62.05 
 
 		 232 aa  290  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  61.64 
 
 		 224 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  59.82 
 
 		 224 aa  266  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  59.82 
 
 		 226 aa  259  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  60.18 
 
 		 691 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  58.82 
 
 		 228 aa  254  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  59.73 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  59.73 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  56.31 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  59.73 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  59.73 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  59.29 
 
 		 242 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  59.29 
 
 		 232 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  60.87 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  56.19 
 
 		 227 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  56.19 
 
 		 227 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  56.19 
 
 		 227 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  50.45 
 
 		 231 aa  238  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  55.71 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  52.4 
 
 		 228 aa  231  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  52.4 
 
 		 228 aa  231  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  53.81 
 
 		 225 aa  228  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  56.82 
 
 		 227 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  53.33 
 
 		 220 aa  219  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4332  ThiJ/PfpI  50 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  52.49 
 
 		 225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2705  ThiJ/PfpI domain-containing protein  57.08 
 
 		 227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2579  ThiJ/PfpI domain-containing protein  56.64 
 
 		 227 aa  215  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  53.47 
 
 		 285 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2847  ThiJ/PfpI family protein  51.49 
 
 		 276 aa  208  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00201065  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  50.48 
 
 		 232 aa  204  7e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2643  ThiJ family protein  51.21 
 
 		 241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.09 
 
 		 242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  51.13 
 
 		 229 aa  198  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.85 
 
 		 239 aa  198  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  50.93 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  48 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5986  ThiJ/PfpI family protein  55.61 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0549226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.71 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  45.18 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  45.18 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.71 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  47.56 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2005  isonitrile hydratase, putative  47.42 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1672  ThiJ/PfpI domain protein  47.42 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.875327 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.17 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.4 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0965747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.64 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0050  ThiJ/PfpI domain protein  44.71 
 
 		 279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7628  intracellular protease/amidase  47.78 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.66836  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.91 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4131  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.84 
 
 		 277 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  42.98 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.9 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4536  DJ-1/PfpI family protein  51.22 
 
 		 261 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3391  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.95 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694944  normal  0.106605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2391  ThiJ/PfpI domain protein  49.22 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  45.05 
 
 		 212 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  43.28 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7236  ThiJ/PfpI family protein  42.45 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0671264 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5955  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.45 
 
 		 284 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5977  ThiJ/PfpI  41.84 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6260  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.43 
 
 		 284 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1653  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.5 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  41.58 
 
 		 245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.58 
 
 		 245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.58 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.68 
 
 		 246 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3882  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.81 
 
 		 284 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.64 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  44.12 
 
 		 222 aa  142  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.41 
 
 		 249 aa  141  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4724  twin-arginine translocation pathway signal  39.34 
 
 		 284 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.34 
 
 		 284 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4265  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.71 
 
 		 251 aa  141  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2879  ThiJ/PfpI  51.09 
 
 		 201 aa  134  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0469  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.57 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  35.68 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  35.68 
 
 		 241 aa  128  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2503  ThiJ/PfpI domain protein  39.89 
 
 		 233 aa  124  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.32 
 
 		 210 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  38.78 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1577  ThiJ/PfpI  38.31 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  39.89 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10051  hypothetical protein  40.72 
 
 		 187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.67 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  35.35 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  31.84 
 
 		 297 aa  111  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  33.86 
 
 		 196 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.9 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.11 
 
 		 188 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.32 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.97 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  31.55 
 
 		 198 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>