More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1999 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  62.31 
 
 
529 aa  688  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
524 aa  1084  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  84.89 
 
 
526 aa  925  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  61.41 
 
 
532 aa  618  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0289  adenylate/guanylate cyclase  59.08 
 
 
526 aa  614  1e-174  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2124  adenylate/guanylate cyclase  56.46 
 
 
516 aa  513  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3398  adenylate/guanylate cyclase  49.82 
 
 
662 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.71233  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2176  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  49.28 
 
 
662 aa  287  3e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  49.3 
 
 
465 aa  279  7e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  44.52 
 
 
479 aa  275  2e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  49.46 
 
 
561 aa  273  5e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  44.79 
 
 
446 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  45.33 
 
 
462 aa  270  6e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  46.1 
 
 
463 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  50.19 
 
 
738 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  40.43 
 
 
460 aa  230  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  2.11521e-07 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1662  adenylate/guanylate cyclase  37.73 
 
 
472 aa  203  5e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.491568  hitchhiker  0.000617786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  45.27 
 
 
665 aa  177  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  37.56 
 
 
758 aa  150  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  1.5313e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  35.02 
 
 
584 aa  148  2e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  35.02 
 
 
584 aa  149  2e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.36 
 
 
656 aa  146  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.36 
 
 
672 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0891  adenylate/guanylate cyclase  35.81 
 
 
822 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508191  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  31.82 
 
 
518 aa  143  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  38.03 
 
 
636 aa  144  6e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  9.55851e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  30.67 
 
 
702 aa  143  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  31.43 
 
 
441 aa  141  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  39.2 
 
 
694 aa  141  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  31.02 
 
 
431 aa  141  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  38.76 
 
 
864 aa  140  4e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  38.21 
 
 
546 aa  141  4e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.94 
 
 
611 aa  140  5e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  36.56 
 
 
1156 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  38.14 
 
 
859 aa  137  3e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  34.92 
 
 
487 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  35.44 
 
 
744 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  38.5 
 
 
546 aa  137  6e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  34.43 
 
 
735 aa  136  7e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1003  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.68 
 
 
879 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.528155 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.85 
 
 
658 aa  133  8e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  34.93 
 
 
528 aa  133  1e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.86 
 
 
761 aa  132  2e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  34.36 
 
 
1180 aa  132  2e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  34.86 
 
 
1172 aa  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  40.66 
 
 
752 aa  130  4e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  32.13 
 
 
936 aa  130  8e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3040  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.39 
 
 
815 aa  130  8e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.28 
 
 
861 aa  129  1e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  33.19 
 
 
729 aa  128  2e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  30.37 
 
 
734 aa  128  2e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0561  putative adenylate/guanylate cyclase  25.4 
 
 
817 aa  128  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  35.68 
 
 
638 aa  127  4e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.2 
 
 
1081 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36 
 
 
757 aa  127  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  31.91 
 
 
746 aa  126  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.74 
 
 
858 aa  126  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  35.89 
 
 
701 aa  126  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  33.95 
 
 
614 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  35.41 
 
 
701 aa  125  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  34.54 
 
 
1093 aa  124  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  34.22 
 
 
712 aa  124  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  1.18563e-06  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  32.57 
 
 
1207 aa  124  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.86 
 
 
701 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  30.86 
 
 
403 aa  123  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  38.04 
 
 
741 aa  122  1e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  35.62 
 
 
483 aa  121  2e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  3.36338e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  34.85 
 
 
632 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
860 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  35.29 
 
 
681 aa  121  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.14 
 
 
656 aa  121  4e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  39.25 
 
 
981 aa  121  4e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  32.08 
 
 
696 aa  120  5e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.33 
 
 
1089 aa  120  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.7 
 
 
1080 aa  120  8e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.02 
 
 
657 aa  120  8e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  33.49 
 
 
911 aa  120  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  31.95 
 
 
667 aa  119  1e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.09 
 
 
465 aa  119  2e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  37.29 
 
 
971 aa  119  2e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  33.65 
 
 
713 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.22 
 
 
648 aa  118  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  41.82 
 
 
652 aa  117  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.51 
 
 
737 aa  117  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  32.04 
 
 
513 aa  115  1e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  33.51 
 
 
1020 aa  115  2e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  31.19 
 
 
726 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  1.97957e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 
1160 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  31.2 
 
 
645 aa  114  4e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  35.71 
 
 
794 aa  114  4e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  34.21 
 
 
675 aa  114  4e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.13 
 
 
678 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  34.53 
 
 
632 aa  113  7e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  31.07 
 
 
699 aa  113  8e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  32.09 
 
 
518 aa  113  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  33.01 
 
 
670 aa  112  1e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  34.43 
 
 
969 aa  112  2e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  32.74 
 
 
684 aa  112  2e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  33.62 
 
 
284 aa  112  2e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  31.91 
 
 
382 aa  111  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>