208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0881 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 320 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  89.58 
 
 		 307 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  86.64 
 
 		 307 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  84.82 
 
 		 308 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  75.08 
 
 		 343 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  75.24 
 
 		 308 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  76.97 
 
 		 308 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  62.21 
 
 		 307 aa  322  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  57.53 
 
 		 307 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  56.52 
 
 		 307 aa  318  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  57.19 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  55.18 
 
 		 305 aa  312  3.9999999999999997e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  55.52 
 
 		 307 aa  305  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  50.49 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  50.99 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  51.16 
 
 		 306 aa  281  8.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  55.52 
 
 		 306 aa  278  9e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  54.85 
 
 		 316 aa  277  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  51.67 
 
 		 306 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  54.52 
 
 		 316 aa  275  6e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  51.16 
 
 		 306 aa  275  7e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  50.17 
 
 		 310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  51.29 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  54.79 
 
 		 307 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  52.67 
 
 		 306 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  55.3 
 
 		 307 aa  249  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  47.51 
 
 		 307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  45.21 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  46.89 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  50.16 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  45.39 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  41.72 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  44.37 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  41.64 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  41 
 
 		 303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  41.06 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  32.03 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  32.12 
 
 		 342 aa  102  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  30.17 
 
 		 352 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  32.75 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  30.11 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  31 
 
 		 356 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  28.12 
 
 		 420 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  27.69 
 
 		 426 aa  89.7  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  28.87 
 
 		 361 aa  87  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  27.61 
 
 		 349 aa  85.9  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  27.7 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  28.88 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  27.78 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  25.9 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  28.32 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  28.04 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  24.28 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  26.2 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  28.15 
 
 		 350 aa  79  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  27.86 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  28.67 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  27.21 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  24.54 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  31.22 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  24.82 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  26.54 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  26.73 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  28.87 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  23.64 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  25.45 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  24.04 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  24.82 
 
 		 257 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  28.78 
 
 		 261 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  30.29 
 
 		 261 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  28.62 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  29.14 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  29.93 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  29.93 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  25.47 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  21.16 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  24.1 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  24.1 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  30.66 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  26.78 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  26.35 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  24.03 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  25.55 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  27.04 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  29.11 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2888  protein of unknown function DUF81  23.21 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  29.11 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  23.46 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0872  hypothetical protein  23.51 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  28.63 
 
 		 355 aa  59.3  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  23.89 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  23.89 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  25.1 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  24.43 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  25.54 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  23.83 
 
 		 266 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  23.83 
 
 		 262 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  29.52 
 
 		 242 aa  57  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  23.83 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  23.83 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>