More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0456 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0456  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 		 231 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  82.68 
 
 		 231 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  82.68 
 
 		 230 aa  346  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  68.83 
 
 		 232 aa  324  6e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  67.42 
 
 		 232 aa  309  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  68.97 
 
 		 231 aa  305  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  68.35 
 
 		 233 aa  281  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  55.71 
 
 		 227 aa  230  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2899  peptidase M22 glycoprotease  45.3 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3199  peptidase M22 glycoprotease  47.03 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150243  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3523  peptidase M22 glycoprotease  46.36 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.0963127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1052  peptidase M22 glycoprotease  46.96 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.310661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3395  peptidase M22 glycoprotease  48.42 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4430  peptidase M22 glycoprotease  47.32 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0939599  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0643  peptidase M22 glycoprotease  49.33 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  39.65 
 
 		 220 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3393  peptidase M22 glycoprotease  46.88 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  46.82 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150711 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  39.56 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  40.64 
 
 		 220 aa  141  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  39.82 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  39.82 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  39.01 
 
 		 229 aa  128  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  43.43 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3916  peptidase M22, glycoprotease  37.27 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3613  peptidase M22 glycoprotease  42.24 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  36.21 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  42.97 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  38.58 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  38.58 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  38.58 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  38.58 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3763  peptidase M22, glycoprotease  46.56 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  38.58 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  38.58 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1241  glycoprotease family protein  32.19 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2213  hypothetical protein  40.48 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0888  peptidase M22, glycoprotease  40.48 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0332753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0800  peptidase M22 glycoprotease  30.9 
 
 		 236 aa  91.7  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  34.69 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  38.1 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  37.21 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  37.01 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  37.21 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  31.61 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  36.05 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  37.21 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2894  peptidase M22, glycoprotease  35.59 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  37.59 
 
 		 236 aa  88.6  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  36.22 
 
 		 231 aa  88.6  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2604  peptidase M22 glycoprotease  36.49 
 
 		 223 aa  88.6  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000523525 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  36.18 
 
 		 236 aa  88.6  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  36.22 
 
 		 231 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  36.22 
 
 		 231 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  36.22 
 
 		 231 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  36.22 
 
 		 231 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  36.22 
 
 		 231 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  36.22 
 
 		 231 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  34.93 
 
 		 236 aa  88.2  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  36.15 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  29.06 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  31.14 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  31.14 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2280  peptidase M22, glycoprotease  37.91 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal  0.567349 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  37.3 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  36.8 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0944  peptidase M22 glycoprotease  29.69 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  36.22 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4043  peptidase M22 glycoprotease  35.59 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  36.36 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0210  endopeptidase-related protein  36.67 
 
 		 191 aa  85.5  6e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  30.7 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1775  peptidase M22, glycoprotease  31.93 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0438332  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3029  peptidase M22, glycoprotease  36.2 
 
 		 213 aa  85.5  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  85.1  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  34.75 
 
 		 241 aa  85.1  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0335  peptidase M22, glycoprotease  34.38 
 
 		 192 aa  85.1  9e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.851961  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  35.23 
 
 		 236 aa  85.1  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1546  peptidase M22 glycoprotease  34.64 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.311826 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  37.59 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0629  peptidase M22 glycoprotease  34.82 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  37.59 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  37.59 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  36.88 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0447  glycoprotease family protein  35.71 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  37.59 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  37.78 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6548  peptidase M22 glycoprotease  36 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  36.8 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  36.8 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  31.44 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  37.69 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  36.43 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  32.87 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  33.33 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  30.26 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  30.84 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  34.59 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  38.1 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  36.43 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>