More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3393 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3393  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 
231 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4430  peptidase M22 glycoprotease  92.67 
 
 
232 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0939599  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3395  peptidase M22 glycoprotease  65.8 
 
 
226 aa  261  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3199  peptidase M22 glycoprotease  68.53 
 
 
226 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150243  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3523  peptidase M22 glycoprotease  65.65 
 
 
226 aa  256  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.0963127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0643  peptidase M22 glycoprotease  63.09 
 
 
224 aa  222  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1052  peptidase M22 glycoprotease  53.91 
 
 
259 aa  211  9e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.310661  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2899  peptidase M22 glycoprotease  53.68 
 
 
234 aa  207  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328536 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  51.54 
 
 
231 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  49.57 
 
 
232 aa  185  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  49.33 
 
 
232 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  49.14 
 
 
227 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  48.44 
 
 
231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  50.66 
 
 
230 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  48.47 
 
 
233 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0456  peptidase M22 glycoprotease  46.88 
 
 
231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  39.66 
 
 
220 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  38.79 
 
 
220 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  38.4 
 
 
229 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  39.13 
 
 
229 aa  121  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  38.66 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  38.66 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  38.84 
 
 
218 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3916  peptidase M22, glycoprotease  36.36 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1241  glycoprotease family protein  31.12 
 
 
235 aa  99  6e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3613  peptidase M22 glycoprotease  43.04 
 
 
230 aa  98.6  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  35 
 
 
215 aa  98.6  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  37.72 
 
 
213 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3029  peptidase M22, glycoprotease  35.24 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  33.87 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1857  peptidase M22 glycoprotease  29.54 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00567012  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1747  glycoprotein endopeptidase  35.42 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.3762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  31.12 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  38.69 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0356  hypothetical protein  35 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0444593 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0629  peptidase M22 glycoprotease  32.62 
 
 
229 aa  79  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147334  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  31.6 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  35.11 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  35.04 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  35.11 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  31.17 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  35.11 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  31.06 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  36.84 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  35.77 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  35.04 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2233  peptidase  32 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000143948  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1000  peptidase M22 glycoprotease  37.24 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  35.04 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  33.33 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  33.33 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  35.97 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0944  peptidase M22 glycoprotease  35.29 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  30.37 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  29.29 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  33.33 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  30.67 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  36.97 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  34.53 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  34.53 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  29.29 
 
 
231 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3849  peptidase M22 glycoprotease  29.44 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434015  normal  0.803149 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  34.67 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3763  peptidase M22, glycoprotease  37.64 
 
 
232 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  29.29 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  29.29 
 
 
231 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  30.29 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  28.87 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  28.87 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1546  peptidase M22 glycoprotease  33.57 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.311826 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  28.87 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  34.53 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  32.3 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  34.53 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0987  peptidase M22, glycoprotease  35.29 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  28.87 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  36.24 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  28.87 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  34.53 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  32.52 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29230  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  35.29 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1759  hypothetical protein  29.41 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.607918  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  35.11 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  29.37 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  32.08 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  39.71 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0341  peptidase M22, glycoprotease  30.57 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  33.66 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  29.67 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  29.79 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0347  peptidase M22 glycoprotease  31.3 
 
 
241 aa  72  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1775  peptidase M22, glycoprotease  26.75 
 
 
236 aa  72  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0438332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0245  hypothetical protein  32.06 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0091  peptidase M22 glycoprotease  32.62 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0427385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0259  hypothetical protein  32.06 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1487  peptidase M22, glycoprotease  37.55 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2069  peptidase M22, glycoprotease  31 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513401  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0358  peptidase M22, glycoprotease  36.6 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0837171 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3663  peptidase M22, glycoprotease  32.31 
 
 
212 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0927  peptidase M22 glycoprotease  31.53 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>