More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3199 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3523  peptidase M22 glycoprotease  99.12 
 
 
226 aa  431  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.0963127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3199  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 
226 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150243  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3395  peptidase M22 glycoprotease  91.15 
 
 
226 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4430  peptidase M22 glycoprotease  68.53 
 
 
232 aa  241  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0939599  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0643  peptidase M22 glycoprotease  68.44 
 
 
224 aa  241  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3393  peptidase M22 glycoprotease  65.22 
 
 
231 aa  236  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2899  peptidase M22 glycoprotease  54.74 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328536 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1052  peptidase M22 glycoprotease  54.95 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.310661  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  53.98 
 
 
227 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  52.86 
 
 
231 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  51.6 
 
 
231 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  50.91 
 
 
232 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  51.82 
 
 
232 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  51.54 
 
 
230 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  49.78 
 
 
233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0456  peptidase M22 glycoprotease  47.49 
 
 
231 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  39.11 
 
 
220 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  38.67 
 
 
220 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  38.18 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  37.89 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  37.5 
 
 
229 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  37.83 
 
 
229 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  38.05 
 
 
218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3916  peptidase M22, glycoprotease  36.04 
 
 
225 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  37.96 
 
 
213 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  36.24 
 
 
215 aa  99  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3613  peptidase M22 glycoprotease  41.78 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  34.59 
 
 
231 aa  95.9  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1241  glycoprotease family protein  34.17 
 
 
235 aa  92.8  4e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  32.61 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  32.61 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3029  peptidase M22, glycoprotease  35.16 
 
 
213 aa  89.4  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  38.1 
 
 
232 aa  89  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  38.1 
 
 
232 aa  89  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  38.1 
 
 
232 aa  89  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  32.61 
 
 
231 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  32.61 
 
 
231 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  32.61 
 
 
231 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  41.09 
 
 
238 aa  88.6  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1747  glycoprotein endopeptidase  36.13 
 
 
228 aa  87.8  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.3762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  38.89 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  32.16 
 
 
233 aa  86.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2233  peptidase  37.5 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000143948  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  28.39 
 
 
236 aa  85.9  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  33.77 
 
 
233 aa  85.9  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  33.61 
 
 
237 aa  85.5  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  35.77 
 
 
231 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0356  hypothetical protein  32.53 
 
 
228 aa  85.1  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0444593 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  37.01 
 
 
231 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  37.01 
 
 
231 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  37.01 
 
 
231 aa  85.1  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  37.01 
 
 
231 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  37.01 
 
 
231 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  37.01 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  37.01 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  33.33 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  35.9 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  35.34 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0379  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  27.62 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.457617  hitchhiker  0.000000359774 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  34.91 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  31.25 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  36.22 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  38.1 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  30.66 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1759  hypothetical protein  32.9 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.607918  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  33.77 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1775  peptidase M22, glycoprotease  28.99 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0438332  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  33.54 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  31.29 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  37.3 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  30.15 
 
 
239 aa  82  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  31.9 
 
 
224 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  31.9 
 
 
224 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  40.16 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  40.16 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3763  peptidase M22, glycoprotease  38.29 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  33.54 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  31.47 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  28.65 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  41.67 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  36.36 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0447  glycoprotease family protein  35.48 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  36.09 
 
 
231 aa  79  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  30 
 
 
224 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0341  peptidase M22, glycoprotease  33.33 
 
 
241 aa  78.6  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  34.92 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  34.5 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  33.08 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  32.28 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  35.71 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  33.07 
 
 
237 aa  77  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1268  peptidase M22, glycoprotease  28.66 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2808  peptidase M22, glycoprotease  30.36 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0327  metal-dependent protease related protein, putative molecular chaperone  30.3 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  28.82 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1487  peptidase M22, glycoprotease  38.25 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  32.12 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  35.47 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  34.31 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  33.87 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>