More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3613 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3613  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 		 230 aa  434  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  45.09 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  43.3 
 
 		 231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  43.05 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  40.43 
 
 		 233 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  39.38 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  42.54 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  39.38 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  38.39 
 
 		 229 aa  128  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  42.6 
 
 		 231 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  41.26 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2604  peptidase M22 glycoprotease  42.49 
 
 		 223 aa  124  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000523525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3199  peptidase M22 glycoprotease  41.89 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150243  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  38.74 
 
 		 220 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  40.77 
 
 		 213 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1146  peptidase M22 glycoprotease  38.43 
 
 		 227 aa  121  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  36.75 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  37.84 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1052  peptidase M22 glycoprotease  39.29 
 
 		 259 aa  119  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.310661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2894  peptidase M22, glycoprotease  40.52 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  40.55 
 
 		 215 aa  118  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3523  peptidase M22 glycoprotease  39.29 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.0963127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3395  peptidase M22 glycoprotease  41.44 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2899  peptidase M22 glycoprotease  41.63 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0456  peptidase M22 glycoprotease  40.87 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  35.59 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0614  peptidase M22 glycoprotease  36.93 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725915  normal  0.446641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3663  peptidase M22, glycoprotease  36.61 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4043  peptidase M22 glycoprotease  40.61 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3393  peptidase M22 glycoprotease  39.65 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  38.33 
 
 		 241 aa  104  9e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3916  peptidase M22, glycoprotease  38.12 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  36.8 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  35.68 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  34.36 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  44.09 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0643  peptidase M22 glycoprotease  41.44 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4430  peptidase M22 glycoprotease  41.23 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0939599  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  46.46 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3029  peptidase M22, glycoprotease  37.12 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1000  peptidase M22 glycoprotease  35.59 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29230  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  38.5 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  34.6 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  34.6 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1857  peptidase M22 glycoprotease  34.06 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00567012  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  34.6 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  34.62 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  32.37 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4263  peptidase M22 glycoprotease  42.42 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3763  peptidase M22, glycoprotease  45.24 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0629  peptidase M22 glycoprotease  37.23 
 
 		 229 aa  98.2  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147334  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  33.76 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  33.33 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  41.73 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  34.19 
 
 		 231 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  33.76 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  33.76 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  33.76 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  44.88 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  33.76 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  33.33 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  32.31 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  34.89 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  34.78 
 
 		 236 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  34.5 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  34.93 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  34.75 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  33.04 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0148  peptidase M22 glycoprotease  36.65 
 
 		 228 aa  96.3  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  33.04 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  34.48 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07480  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  36.91 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.308206  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  34.48 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1410  peptidase M22 glycoprotease  37.5 
 
 		 266 aa  95.9  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  34.48 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  33.04 
 
 		 237 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1913  metal-dependent protease  34.93 
 
 		 233 aa  95.1  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0333052  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  32.6 
 
 		 237 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  33.19 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  33.64 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  32.21 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  34.48 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  35.87 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2598  peptidase M22 glycoprotease  39.15 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0896201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  34.48 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0358  peptidase M22, glycoprotease  34.5 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0837171 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1673  peptidase M22, glycoprotease  32.66 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  40.94 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0731  peptidase M22 glycoprotease  39.3 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0874562  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1268  peptidase M22, glycoprotease  31.58 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1391  peptidase M22 glycoprotease  30.3 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000832703  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  31.49 
 
 		 236 aa  92.8  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  35.43 
 
 		 456 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16700  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  39.57 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.568455  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  37.67 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6394  peptidase M22 glycoprotease  32.44 
 
 		 235 aa  92  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0429104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0863  peptidase M22, glycoprotease  37.84 
 
 		 215 aa  92  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1546  peptidase M22 glycoprotease  33.18 
 
 		 230 aa  91.7  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.311826 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1241  glycoprotease family protein  29.46 
 
 		 235 aa  91.7  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>