More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0904 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  509  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  80.57 
 
 		 253 aa  402  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  57.74 
 
 		 273 aa  298  7e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  51.79 
 
 		 263 aa  259  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  43.54 
 
 		 621 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  38.74 
 
 		 861 aa  151  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  40.68 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  44.92 
 
 		 1392 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0064  hypothetical protein  33.86 
 
 		 312 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 		 1818 aa  122  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  42.07 
 
 		 1049 aa  121  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1626  hypothetical protein  37.85 
 
 		 329 aa  121  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  37.04 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  36.57 
 
 		 413 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  32.95 
 
 		 820 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1282  serine/threonine kinase  39.73 
 
 		 327 aa  118  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0376412  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  41.36 
 
 		 1007 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  36.93 
 
 		 444 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  36.69 
 
 		 497 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  36.15 
 
 		 781 aa  115  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  37.44 
 
 		 616 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  35.62 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  36.57 
 
 		 852 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  43.53 
 
 		 960 aa  113  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  41.61 
 
 		 923 aa  113  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  40.61 
 
 		 1186 aa  113  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  37.5 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  36.93 
 
 		 444 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  36.14 
 
 		 523 aa  112  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  36.01 
 
 		 468 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  41.88 
 
 		 965 aa  112  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1587  hypothetical protein  39.27 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0084  TRP-2  39.27 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1504  hypothetical protein  39.27 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.898087  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  39.05 
 
 		 654 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  37.67 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  31.52 
 
 		 436 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0185  transcriptional regulator, XRE family  36.79 
 
 		 311 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  36.21 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  37.8 
 
 		 657 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  30.31 
 
 		 416 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  35.02 
 
 		 437 aa  108  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  29.03 
 
 		 433 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  34.9 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  34.77 
 
 		 433 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  34.18 
 
 		 439 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  42.59 
 
 		 1200 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  41.07 
 
 		 1049 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  31.62 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.83 
 
 		 554 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  28.88 
 
 		 586 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  31.87 
 
 		 1104 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  41.07 
 
 		 1581 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  38.85 
 
 		 842 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1321  protein of unknown function DUF323  34.55 
 
 		 270 aa  105  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.329702  hitchhiker  0.00614552 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  39.63 
 
 		 1053 aa  105  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  30.11 
 
 		 826 aa  105  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  34.16 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  38.22 
 
 		 1492 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  33.7 
 
 		 892 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  31.52 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  30.04 
 
 		 325 aa  102  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  32.08 
 
 		 929 aa  102  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  26.79 
 
 		 319 aa  102  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  34.25 
 
 		 491 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  34.4 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0831  hypothetical protein  29.53 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0420887  unclonable  0.0000101596 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  37.87 
 
 		 1201 aa  101  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  33.56 
 
 		 316 aa  101  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  36.19 
 
 		 611 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  30.35 
 
 		 398 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  33.46 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  33.96 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  38.92 
 
 		 510 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  34.63 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  34.15 
 
 		 442 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  40.24 
 
 		 1023 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4948  protein of unknown function DUF323  33.22 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  31.2 
 
 		 1911 aa  99.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  29.18 
 
 		 829 aa  99.4  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  37.8 
 
 		 487 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  38.92 
 
 		 1044 aa  98.6  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  33.94 
 
 		 442 aa  98.6  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  39.62 
 
 		 570 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  37.67 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  35.68 
 
 		 446 aa  97.1  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  30.32 
 
 		 538 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  33.85 
 
 		 351 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  36.42 
 
 		 957 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  33.59 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  30.74 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  37.34 
 
 		 446 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  34.23 
 
 		 1132 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 		 637 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  31.91 
 
 		 614 aa  95.5  7e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  32.61 
 
 		 437 aa  95.5  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  30.31 
 
 		 617 aa  95.5  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  30.45 
 
 		 751 aa  95.5  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  35.68 
 
 		 668 aa  94.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  32.4 
 
 		 625 aa  94.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>