More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2412 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2412  elongation factor P  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0259634 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2246  elongation factor P  93.55 
 
 		 186 aa  361  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0849  elongation factor P  85.41 
 
 		 185 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0141003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1093  elongation factor P  84.86 
 
 		 185 aa  325  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2891  elongation factor P  84.32 
 
 		 185 aa  322  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.665386  normal  0.0670504 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1069  elongation factor P  81.18 
 
 		 188 aa  320  7e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0510953  normal  0.169109 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1737  elongation factor P  81.62 
 
 		 185 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.862842  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0413  elongation factor P  80.11 
 
 		 186 aa  311  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.154549  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2822  elongation factor P  81.62 
 
 		 185 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0858558  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0550  elongation factor P  81.62 
 
 		 185 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2771  elongation factor P  81.62 
 
 		 185 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2886  elongation factor P  81.62 
 
 		 185 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1782  elongation factor P  81.62 
 
 		 185 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0461395  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2833  elongation factor P  81.62 
 
 		 185 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2459  elongation factor P  81.62 
 
 		 185 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2163  elongation factor P  80.54 
 
 		 185 aa  308  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0661  elongation factor P  80.54 
 
 		 185 aa  308  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.551616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1099  elongation factor P  80.54 
 
 		 185 aa  308  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1141  elongation factor P  80.54 
 
 		 185 aa  308  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4253  elongation factor P  80 
 
 		 185 aa  306  8e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1017  elongation factor P  80 
 
 		 185 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1021  elongation factor P  80 
 
 		 185 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0421  elongation factor P  77.96 
 
 		 186 aa  304  6e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1755  elongation factor P  78.8 
 
 		 185 aa  300  1e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0132  elongation factor P  76.63 
 
 		 185 aa  290  8e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0857  elongation factor P  73.8 
 
 		 186 aa  278  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.479626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2035  elongation factor P  72.83 
 
 		 185 aa  278  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.373197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0999  elongation factor P  71.81 
 
 		 191 aa  269  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.692451  normal  0.398098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0934  elongation factor P  71.81 
 
 		 191 aa  269  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal  0.0465306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1779  elongation factor P  71.74 
 
 		 184 aa  268  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1962  elongation factor P  70.11 
 
 		 199 aa  268  5e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0767927  normal  0.96183 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15280  elongation factor P  68.98 
 
 		 188 aa  267  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00757913  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1648  elongation factor P  71.2 
 
 		 184 aa  267  8e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1934  elongation factor P  67.39 
 
 		 184 aa  266  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.204738 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2242  elongation factor P  69.57 
 
 		 184 aa  266  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208447  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0565  translation elongation factor P  67.02 
 
 		 189 aa  265  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2875  elongation factor P  69.57 
 
 		 184 aa  265  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.220624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2362  elongation factor P  69.57 
 
 		 184 aa  265  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.681402  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2304  elongation factor P  68.28 
 
 		 188 aa  261  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0302862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27210  elongation factor P  68.28 
 
 		 188 aa  261  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.791467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1625  elongation factor P  68.48 
 
 		 184 aa  259  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.531949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3074  elongation factor P  68.48 
 
 		 184 aa  259  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2871  elongation factor P  68.48 
 
 		 184 aa  259  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3233  elongation factor P  68.48 
 
 		 184 aa  257  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.475124  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1699  elongation factor P  60.85 
 
 		 188 aa  230  8.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000109401  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1992  elongation factor P  58.82 
 
 		 186 aa  228  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000014351  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1915  elongation factor P  59.89 
 
 		 186 aa  227  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120633  unclonable  0.00000167912 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1908  elongation factor P  58.6 
 
 		 186 aa  225  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000484999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2339  elongation factor P  58.29 
 
 		 186 aa  224  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0127708  hitchhiker  0.0000774708 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2268  elongation factor P  58.6 
 
 		 186 aa  224  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.04773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2049  elongation factor P  58.06 
 
 		 186 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000851493  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1875  elongation factor P  60.22 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000405635  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2189  elongation factor P  59.14 
 
 		 186 aa  213  9e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000173  unclonable  0.00000474923 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2232  elongation factor P  59.14 
 
 		 186 aa  213  9e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000315255  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2245  elongation factor P  59.14 
 
 		 186 aa  213  9e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000454991  decreased coverage  0.0000000000324957 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4518  elongation factor P  59.14 
 
 		 186 aa  213  9e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2139  elongation factor P  59.14 
 
 		 186 aa  213  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000480024  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2328  elongation factor P  59.14 
 
 		 186 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2038  elongation factor P  59.14 
 
 		 186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000835391  hitchhiker  0.00115399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1937  elongation factor P  59.14 
 
 		 186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000886645  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2141  elongation factor P  59.14 
 
 		 186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.000269097 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1898  Elongation factor P  53.72 
 
 		 189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.185446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2130  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  52.66 
 
 		 190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0576423  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3628  elongation factor P  49.74 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000158679  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3999  elongation factor P  49.74 
 
 		 189 aa  175  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000867749  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1765  translation elongation factor P  49.21 
 
 		 189 aa  174  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1433  elongation factor P  46.81 
 
 		 189 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1468  elongation factor P  46.81 
 
 		 189 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1858  elongation factor P  46.81 
 
 		 189 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.453569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3856  elongation factor P  46.81 
 
 		 189 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198418  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0996  translation elongation factor P  45.55 
 
 		 190 aa  165  4e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  43.96 
 
 		 186 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2275  translation elongation factor P  41.36 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  43.78 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  37.63 
 
 		 185 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  37.3 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  43.95 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  37.63 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  36.76 
 
 		 187 aa  125  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  38.71 
 
 		 185 aa  125  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2489  elongation factor P  35.68 
 
 		 187 aa  124  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  34.22 
 
 		 187 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  35.68 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1795  translation elongation factor P  42.41 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  35.68 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  35.71 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  37.1 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  36.22 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0720  elongation factor P  34.95 
 
 		 185 aa  121  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000911584  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14700  translation elongation factor P (EF-P)  35.48 
 
 		 185 aa  121  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.948878  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  35.83 
 
 		 186 aa  121  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  35.83 
 
 		 187 aa  121  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  34.59 
 
 		 187 aa  120  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  41.61 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  40 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2021  translation elongation factor P  38.46 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  38.55 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  35.71 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  34.22 
 
 		 186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  40.37 
 
 		 185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>