More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2215 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 270 aa  546  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 243 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 256 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 249 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 225 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 248 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  39.08 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 249 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 247 aa  135  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  38.79 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  36.17 
 
 		 250 aa  128  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 239 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  37.29 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.63 
 
 		 239 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2758  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.2 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 240 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 249 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 254 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2332  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1636  transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.496751  normal  0.709152 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 247 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 		 242 aa  119  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  34.2 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 		 252 aa  115  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2760  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0304853  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  33.73 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  31.2 
 
 		 243 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 286 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1763  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.102189 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 241 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 244 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 244 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 244 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  35.74 
 
 		 244 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 244 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 244 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 239 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 251 aa  112  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 267 aa  112  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5049  histidine utilization repressor  32.14 
 
 		 251 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00586645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  26.58 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 238 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 241 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 252 aa  109  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 255 aa  109  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  34.2 
 
 		 242 aa  109  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 195 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 195 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 248 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 248 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 248 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 248 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>