122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1010 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  100 
 
 		 361 aa  721    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  46.22 
 
 		 343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  46.67 
 
 		 343 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  48.17 
 
 		 343 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  48.46 
 
 		 335 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  45.93 
 
 		 343 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  47.87 
 
 		 343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  47.56 
 
 		 343 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  47.56 
 
 		 343 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  47.56 
 
 		 343 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  47.87 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  47.43 
 
 		 343 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  47.83 
 
 		 335 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  48.96 
 
 		 343 aa  248  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  45.73 
 
 		 380 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  48 
 
 		 376 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  48 
 
 		 377 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  47.38 
 
 		 375 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  43.52 
 
 		 349 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  42.72 
 
 		 323 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  33.83 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  41.85 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  41.72 
 
 		 331 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  41.21 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  43.93 
 
 		 318 aa  189  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  37.89 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  38.9 
 
 		 343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  37.74 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  35.65 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  38.44 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  39.06 
 
 		 335 aa  172  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  39.81 
 
 		 325 aa  170  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  43.08 
 
 		 315 aa  169  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  39.44 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  37.81 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  29.64 
 
 		 330 aa  164  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  35.16 
 
 		 359 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  39.81 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  38.68 
 
 		 342 aa  159  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  33.53 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  38.41 
 
 		 382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  30.46 
 
 		 377 aa  155  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  34.17 
 
 		 330 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  36.61 
 
 		 346 aa  155  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  34.06 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  34.06 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  33.23 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  33.43 
 
 		 392 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  34.56 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  35.41 
 
 		 367 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  30.15 
 
 		 377 aa  153  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  32.19 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  31.94 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  35.74 
 
 		 380 aa  150  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  35.33 
 
 		 359 aa  146  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  31.87 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  32.69 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  32.69 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  32.69 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  35.12 
 
 		 331 aa  135  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  32.51 
 
 		 332 aa  132  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  31.13 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3661  hypothetical protein  34.03 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.505633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  31.99 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  31.99 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  31.99 
 
 		 335 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  36.44 
 
 		 349 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  33.9 
 
 		 327 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22840  nitroreductase family protein  31.29 
 
 		 326 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13147  hypothetical protein  34.45 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.825621 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4128  hypothetical protein  32.72 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4203  hypothetical protein  32.72 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4359  hypothetical protein  32.72 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  31.71 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  33.33 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  33.33 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  33.33 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  27.14 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  33.83 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1075  hypothetical protein  29.57 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1091  hypothetical protein  29.57 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.202469  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1102  hypothetical protein  29.57 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0127461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2579  hypothetical protein  39.19 
 
 		 279 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  29.47 
 
 		 679 aa  90.5  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2624  hypothetical protein  39.19 
 
 		 297 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  27.42 
 
 		 375 aa  89.7  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  29.36 
 
 		 364 aa  90.1  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2618  hypothetical protein  37.84 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  28.16 
 
 		 351 aa  87.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1006 aa  86.3  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0168  hypothetical protein  39.19 
 
 		 273 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  24.61 
 
 		 770 aa  80.5  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  30.2 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  22.96 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  28.77 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  28.83 
 
 		 730 aa  76.3  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  25.16 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  27.69 
 
 		 968 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4376  hypothetical protein  31.93 
 
 		 710 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0489  hypothetical protein  41.75 
 
 		 271 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143021 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>