213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0768 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0768  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 
348 aa  701    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1323  flagellar motor switch protein FliM  35.56 
 
 
335 aa  218  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1937  flagellar motor switch protein FliM  35.45 
 
 
343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2763  flagellar motor switch protein FliM  34.28 
 
 
344 aa  211  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1405  flagellar motor switch protein FliM  34.03 
 
 
333 aa  206  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0861  hypothetical protein  32.42 
 
 
328 aa  199  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2161  flagellar motor switch protein FliM  31.91 
 
 
329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.287606  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0284  flagellar motor switch protein FliM  34.14 
 
 
352 aa  192  9e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2014  flagellar motor switch protein FliM  33.44 
 
 
334 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1122  flagellar motor switch protein FliM  34.35 
 
 
334 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16750  flagellar motor switch protein FliM  31.82 
 
 
334 aa  190  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000123486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4143  flagellar motor switch protein FliM  32.24 
 
 
331 aa  189  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2039  flagellar motor switch protein FliM  32.73 
 
 
328 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0804  flagellar motor switch protein FliM  31.72 
 
 
323 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2018  flagellar motor switch protein FliM  35.45 
 
 
327 aa  186  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0477  flagellar motor switch protein FliM  30.91 
 
 
328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00127431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1681  flagellar motor switch protein FliM  31.33 
 
 
332 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1512  flagellar motor switch protein FliM  31.85 
 
 
363 aa  181  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1439  flagellar motor switch protein FliM  32.13 
 
 
366 aa  179  4e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000909071  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1298  flagellar motor switch protein FliM  35.22 
 
 
329 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0113  flagellar motor switch protein FliM  33.13 
 
 
359 aa  177  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0297  flagellar motor switch protein FliM  31.55 
 
 
353 aa  176  6e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000388238  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1737  flagellar motor switch protein FliM  33.13 
 
 
332 aa  176  7e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1020  flagellar motor switch protein FliM  31.53 
 
 
367 aa  176  7e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0820225  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0057  flagellar motor switch protein FliM  30.93 
 
 
359 aa  175  9e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0070  flagellar motor switch protein FliM  30.93 
 
 
359 aa  175  9e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0098  flagellar motor switch protein FliM  30.93 
 
 
359 aa  175  9e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0237  flagellar motor switch protein FliM  31.66 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2703  flagellar motor switch protein FliM  29.13 
 
 
325 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.250527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0716  flagellar motor switch protein FliM  30.38 
 
 
334 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0250  flagellar motor switch protein FliM  35.95 
 
 
328 aa  169  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0252  flagellar motor switch protein FliM  35.65 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1402  flagellar motor switch protein FliM  31.4 
 
 
331 aa  166  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2500  flagellar motor switch protein FliM  29.71 
 
 
375 aa  166  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2381  flagellar motor switch protein FliM  30.96 
 
 
330 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1532  flagellar motor switch protein FliM  30.61 
 
 
329 aa  161  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0707  flagellar motor switch protein FliM  29.46 
 
 
372 aa  158  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  29.64 
 
 
326 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  28.02 
 
 
326 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3568  flagellar motor switch protein FliM  26.63 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  28.4 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  32.31 
 
 
338 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0412  flagellar motor switch protein FliM  27.86 
 
 
351 aa  122  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  29.93 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  28.7 
 
 
326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  29.39 
 
 
334 aa  119  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0854  flagellar motor switch protein FliM  27.15 
 
 
314 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  28.08 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  28.08 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  25.6 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  27.49 
 
 
381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  27.76 
 
 
326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  28.81 
 
 
335 aa  116  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  27.58 
 
 
395 aa  115  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1636  flagellar motor switch protein FliM  28.53 
 
 
329 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240245  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  26.35 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  26.2 
 
 
352 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  28.57 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  24.32 
 
 
343 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  24.32 
 
 
343 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  25.76 
 
 
354 aa  113  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  25.07 
 
 
352 aa  113  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  24.32 
 
 
343 aa  113  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  27.99 
 
 
332 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  26.52 
 
 
336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  27.63 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  24.85 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  27.3 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  27.79 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  28.49 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  27.3 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  28.49 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  25.23 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  24.02 
 
 
343 aa  110  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2014  flagellar motor switch protein FliM  22.55 
 
 
308 aa  109  8.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1239  flagellar motor switch protein FliM  28.28 
 
 
334 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2721  flagellar motor switch protein FliM  28.28 
 
 
334 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048647  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2045  flagellar motor switch protein FliM  28.28 
 
 
334 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0461254  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2582  flagellar motor switch protein FliM  27.27 
 
 
337 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31090  flagellar motor switch protein  24.21 
 
 
315 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854888  normal  0.579605 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2178  flagellar motor switch protein FliM  28.28 
 
 
334 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1697  flagellar motor switch protein FliM  28.28 
 
 
334 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0329875 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1703  flagellar motor switch protein FliM  28.28 
 
 
334 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0313377  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  23.42 
 
 
342 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1663  flagellar motor switch protein FliM  26.41 
 
 
314 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.327123  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  27.36 
 
 
332 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  23.8 
 
 
343 aa  106  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1884  flagellar motor switch protein FliM  26.94 
 
 
337 aa  106  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2536  flagellar motor switch protein FliM  28.28 
 
 
334 aa  106  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  27.7 
 
 
332 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  27.7 
 
 
332 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  27.7 
 
 
332 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  28.04 
 
 
332 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  27.36 
 
 
332 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  27.03 
 
 
332 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  27.36 
 
 
332 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  25.37 
 
 
342 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  27.03 
 
 
332 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  27.36 
 
 
332 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  27.36 
 
 
332 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>