More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0575 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
320 aa  633    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  42.34 
 
 
313 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  38.26 
 
 
312 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  36.4 
 
 
316 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  40.48 
 
 
235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  37.1 
 
 
321 aa  162  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
310 aa  162  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  35.69 
 
 
597 aa  159  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.35 
 
 
295 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  42.98 
 
 
672 aa  159  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  35.53 
 
 
337 aa  159  8e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  39.44 
 
 
324 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 
323 aa  152  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  41.63 
 
 
318 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  34.77 
 
 
318 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  33.11 
 
 
333 aa  149  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  38.04 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 
302 aa  146  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  40.62 
 
 
333 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  45.37 
 
 
300 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  36.07 
 
 
335 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  40.1 
 
 
289 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 
314 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  38.52 
 
 
380 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 
299 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  36.33 
 
 
398 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  42.71 
 
 
333 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  36.99 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
310 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  45.81 
 
 
308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  44.71 
 
 
325 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  42.25 
 
 
331 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  40.45 
 
 
294 aa  139  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 
303 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  42.78 
 
 
1035 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  33.19 
 
 
332 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  38.71 
 
 
373 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  34.44 
 
 
349 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  36.68 
 
 
374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  38 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
326 aa  126  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
305 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  40.19 
 
 
276 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  41.79 
 
 
326 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  35.22 
 
 
344 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 
335 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  36.3 
 
 
275 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
367 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  32.64 
 
 
255 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.72 
 
 
324 aa  119  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  33.97 
 
 
338 aa  119  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
581 aa  119  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.47 
 
 
312 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  41.84 
 
 
321 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  35 
 
 
230 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  36.19 
 
 
307 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  35.98 
 
 
345 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51220  glycosyl transferase  36.94 
 
 
330 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00120111  hitchhiker  0.000215045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  36.95 
 
 
337 aa  116  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  33.45 
 
 
357 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
316 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.92 
 
 
326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 
379 aa  115  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.08 
 
 
326 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 
327 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  34.13 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  37.79 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.02 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  34.93 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.25 
 
 
326 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
318 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
363 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  37.34 
 
 
338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2652  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  36.91 
 
 
361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 
1250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  36.92 
 
 
573 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.75 
 
 
327 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
291 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 
349 aa  112  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.37 
 
 
466 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  35.42 
 
 
347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  32.13 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  34.84 
 
 
847 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.14 
 
 
367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  32.1 
 
 
358 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  47.71 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0383  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4911  family 2 glycosyl transferase  36.36 
 
 
316 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  32.7 
 
 
306 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>