More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0095 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0095  CBS domain containing protein  100 
 
 		 416 aa  817    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0451  CBS domain-containing protein  37.25 
 
 		 417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.247844 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  34.67 
 
 		 420 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1275  protein of unknown function DUF21  31.19 
 
 		 435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1440  transporter-associated region  34.15 
 
 		 427 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.252148 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2686  transporter-associated region  43.72 
 
 		 400 aa  209  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  34.24 
 
 		 430 aa  207  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1017  CBS domain containing protein  30.34 
 
 		 421 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1414  hypothetical protein  30.51 
 
 		 419 aa  203  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  33.72 
 
 		 434 aa  202  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  30.7 
 
 		 443 aa  196  6e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2560  protein of unknown function DUF21  33.89 
 
 		 420 aa  192  8e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000312392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1539  hypothetical protein  29.34 
 
 		 431 aa  192  9e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0912  hypothetical protein  31.3 
 
 		 412 aa  189  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0385  protein of unknown function DUF21  29.91 
 
 		 434 aa  187  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000237967  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04200  putative hemolysin  30.73 
 
 		 429 aa  187  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.545831  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  33.41 
 
 		 420 aa  186  7e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  34.2 
 
 		 447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  33.1 
 
 		 446 aa  184  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  40 
 
 		 273 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0384  CBS domain containing protein  27.99 
 
 		 433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000548164  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  29.73 
 
 		 429 aa  180  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  31.21 
 
 		 455 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  31.13 
 
 		 434 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  30.97 
 
 		 455 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  38.7 
 
 		 273 aa  176  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  31.37 
 
 		 426 aa  176  7e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  31.84 
 
 		 447 aa  175  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1886  CBS domain-containing protein  37.99 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.112037  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1951  magnesium and cobalt efflux protein  37.99 
 
 		 323 aa  173  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  30.91 
 
 		 446 aa  172  7.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  29.57 
 
 		 448 aa  172  9e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  28.9 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  29.4 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  30.33 
 
 		 433 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  32.95 
 
 		 430 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  33.26 
 
 		 479 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  38.02 
 
 		 259 aa  171  3e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  29.84 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  30.48 
 
 		 477 aa  169  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  28.64 
 
 		 431 aa  169  8e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  28.47 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  38.89 
 
 		 371 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  32.21 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  28.54 
 
 		 422 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  33.18 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  28.06 
 
 		 424 aa  168  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  26.46 
 
 		 429 aa  167  4e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  29.48 
 
 		 468 aa  167  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  30.02 
 
 		 467 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  38.63 
 
 		 275 aa  166  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  33.57 
 
 		 431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  27.29 
 
 		 424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  39.38 
 
 		 285 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  38.44 
 
 		 421 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  28.61 
 
 		 445 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  31.87 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  32.86 
 
 		 442 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0762  hypothetical protein  32.95 
 
 		 456 aa  164  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0171545  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  34.51 
 
 		 443 aa  163  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  27.06 
 
 		 424 aa  163  6e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  35.91 
 
 		 285 aa  163  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  30.47 
 
 		 432 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  31.34 
 
 		 443 aa  163  7e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  32.19 
 
 		 464 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  36.72 
 
 		 298 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  28.64 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  28.01 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  28.01 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  28.36 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  27.56 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  33.18 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  29.57 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  34.92 
 
 		 445 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  31.22 
 
 		 434 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  27.83 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  30.57 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  34.71 
 
 		 439 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2595  hypothetical protein  31.1 
 
 		 476 aa  159  6e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  40 
 
 		 284 aa  159  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  33.83 
 
 		 425 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  30.17 
 
 		 425 aa  159  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  34.97 
 
 		 444 aa  159  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  32.43 
 
 		 533 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0419  protein of unknown function DUF21  30.27 
 
 		 429 aa  159  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3839  hypothetical protein  39.32 
 
 		 425 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1606  hemolysin-like protein  31.31 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0714858  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  29.16 
 
 		 425 aa  159  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  38.2 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  26.68 
 
 		 424 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  32.84 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  31.97 
 
 		 421 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0886  hypothetical protein  30.88 
 
 		 429 aa  158  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.2 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  31.74 
 
 		 464 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  27.01 
 
 		 437 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1156  hypothetical protein  27.16 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0523696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  28.78 
 
 		 447 aa  157  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  29.05 
 
 		 440 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0450  CBS transporter-associated protein  37.24 
 
 		 295 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00559232  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>