More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6669 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
313 aa  607  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.17 
 
 
313 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.14 
 
 
313 aa  553  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5088  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  83.39 
 
 
313 aa  507  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.3 
 
 
313 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.94 
 
 
313 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.06 
 
 
317 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.650589  normal  0.092891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.86 
 
 
313 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.84 
 
 
313 aa  292  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.16 
 
 
313 aa  290  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.65 
 
 
313 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.84 
 
 
313 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.56 
 
 
313 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18831  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.65 
 
 
313 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.33 
 
 
313 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.45 
 
 
313 aa  285  9e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  46.39 
 
 
313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.83 
 
 
314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  48.32 
 
 
298 aa  282  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.33 
 
 
313 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 
334 aa  279  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.6 
 
 
313 aa  279  5e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.45 
 
 
306 aa  275  8e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.23 
 
 
315 aa  274  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.34 
 
 
320 aa  273  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663455  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  45.07 
 
 
336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  44.78 
 
 
336 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.24 
 
 
334 aa  268  7e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5089  branched-chain amino acid ABC transporter membrane protein  48.71 
 
 
311 aa  268  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.242511  normal  0.40775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.15 
 
 
313 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.24 
 
 
333 aa  267  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.07 
 
 
336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  44.78 
 
 
336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.07 
 
 
336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.05 
 
 
308 aa  266  4e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  43.88 
 
 
336 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  45.07 
 
 
336 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  42.56 
 
 
337 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  40.41 
 
 
339 aa  265  5.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.9 
 
 
306 aa  265  7e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  45.07 
 
 
336 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.41 
 
 
313 aa  264  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.07 
 
 
336 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  40.24 
 
 
339 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  40.24 
 
 
339 aa  263  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  40.71 
 
 
339 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  40.24 
 
 
339 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 
334 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  40.24 
 
 
339 aa  263  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  40.24 
 
 
339 aa  263  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  40.24 
 
 
339 aa  263  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  40.71 
 
 
339 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  40.24 
 
 
339 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  40.24 
 
 
339 aa  263  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  44.48 
 
 
336 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  40.24 
 
 
381 aa  263  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  40.41 
 
 
339 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  40.41 
 
 
339 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  40.41 
 
 
339 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  40.41 
 
 
339 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.27 
 
 
318 aa  262  6.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.823001  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.72 
 
 
335 aa  261  8e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.73 
 
 
313 aa  261  8.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.589529  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  39.94 
 
 
339 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  40.41 
 
 
339 aa  259  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  42.31 
 
 
313 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  39.64 
 
 
339 aa  259  4e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  42.81 
 
 
306 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.13 
 
 
311 aa  259  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  42.81 
 
 
306 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  42.81 
 
 
306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.44 
 
 
345 aa  258  9e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16813  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  40.12 
 
 
351 aa  258  9e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  42.81 
 
 
306 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  42.81 
 
 
306 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.1 
 
 
311 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.893749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.04 
 
 
334 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 
315 aa  255  5e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3891  ABC di/oligopeptide transporter, inner membrane subunit  43.59 
 
 
317 aa  255  7e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  40.6 
 
 
336 aa  255  8e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  42.17 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.17 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.17 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.59 
 
 
314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  43.45 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  42.17 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  42.17 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  42.17 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  42.17 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.59 
 
 
317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.627017 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.45 
 
 
306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  42.17 
 
 
306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.51 
 
 
308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
314 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45 
 
 
319 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540957  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.17 
 
 
306 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.45 
 
 
313 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.951896 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.87 
 
 
318 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3377  dipeptide ABC transporter, permease protein  43.92 
 
 
338 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2120  dipeptide ABC transporter, permease protein  43.92 
 
 
338 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>