More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4285 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  100 
 
 		 106 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  98.11 
 
 		 106 aa  207  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  85.71 
 
 		 107 aa  186  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  83.02 
 
 		 106 aa  184  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  79.05 
 
 		 107 aa  175  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  74.53 
 
 		 107 aa  167  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  73.58 
 
 		 107 aa  164  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  73.58 
 
 		 107 aa  164  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  65.38 
 
 		 107 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  63.21 
 
 		 107 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  63.21 
 
 		 106 aa  148  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  62.26 
 
 		 107 aa  147  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  61.32 
 
 		 119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  61.32 
 
 		 106 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  65.69 
 
 		 107 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  60.95 
 
 		 107 aa  140  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  61.9 
 
 		 106 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  57.14 
 
 		 106 aa  136  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  58.1 
 
 		 106 aa  136  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  60.95 
 
 		 106 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  60.95 
 
 		 106 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  61.9 
 
 		 106 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  60.95 
 
 		 106 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  59.6 
 
 		 107 aa  134  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  64.84 
 
 		 109 aa  133  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  59.62 
 
 		 106 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  62.11 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  61.22 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  62.11 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  60.61 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  61.76 
 
 		 106 aa  131  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  54.29 
 
 		 106 aa  130  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  58.65 
 
 		 106 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  61.05 
 
 		 148 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  61.05 
 
 		 107 aa  130  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  61.7 
 
 		 107 aa  130  7.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1411  thioredoxin  62.5 
 
 		 107 aa  130  9e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  57.58 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  60.64 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  57.14 
 
 		 106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  57.58 
 
 		 107 aa  128  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  58.95 
 
 		 107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  58.95 
 
 		 107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  60.2 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  58.95 
 
 		 107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  60.2 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  58.1 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  57.58 
 
 		 107 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  58.1 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  58.1 
 
 		 106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  60.64 
 
 		 107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  60.44 
 
 		 107 aa  126  9.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  58.95 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  55.91 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  59 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  57 
 
 		 108 aa  125  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  60 
 
 		 115 aa  124  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  58.1 
 
 		 106 aa  125  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  57.28 
 
 		 107 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  57.43 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  62.77 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  57.43 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  57.14 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  55.34 
 
 		 108 aa  124  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  54.26 
 
 		 110 aa  123  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  58.33 
 
 		 108 aa  123  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  56.44 
 
 		 105 aa  123  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  58.25 
 
 		 108 aa  123  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  55.34 
 
 		 108 aa  123  8.000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  57.28 
 
 		 109 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  54 
 
 		 105 aa  123  9e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  58.24 
 
 		 108 aa  123  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  55.77 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  56.25 
 
 		 104 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  49.06 
 
 		 111 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  53.61 
 
 		 110 aa  123  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  54.74 
 
 		 110 aa  122  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  53.4 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  52.94 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  57.29 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  53.4 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  56.25 
 
 		 108 aa  121  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  53.92 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  58.33 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  55.45 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  55.79 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  52.94 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  57.28 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  56.25 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  56.25 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  52.63 
 
 		 110 aa  120  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  56.67 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  51.58 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  55.79 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  56.67 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  54.64 
 
 		 110 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  54 
 
 		 108 aa  120  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  50.98 
 
 		 106 aa  120  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  56.86 
 
 		 106 aa  120  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  56.25 
 
 		 108 aa  120  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>