70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0984 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0984  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 315 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0597  homocysteine S-methyltransferase  66.98 
 
 		 322 aa  461  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1107  homocysteine S-methyltransferase  56.83 
 
 		 313 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0120891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2696  homocysteine S-methyltransferase  56.55 
 
 		 328 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0089  homocysteine S-methyltransferase  55.77 
 
 		 312 aa  364  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.898737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0064  homocysteine S-methyltransferase  56.23 
 
 		 328 aa  362  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5017  homocysteine S-methyltransferase  56.73 
 
 		 312 aa  358  8e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3671  homocysteine S-methyltransferase  53.16 
 
 		 316 aa  345  8e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0624  homocysteine S-methyltransferase  53.97 
 
 		 312 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0417  homocysteine S-methyltransferase  51.44 
 
 		 314 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0769316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2467  homocysteine S-methyltransferase  49.18 
 
 		 330 aa  308  9e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0740  homocysteine S-methyltransferase  48.3 
 
 		 311 aa  268  5.9999999999999995e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1304  homocysteine S-methyltransferase  46.26 
 
 		 311 aa  266  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.652458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6335  homocysteine S-methyltransferase  46.78 
 
 		 307 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1943  putative homocysteine/selenocysteine methylase  43 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3324  homocysteine S-methyltransferase  37.81 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5337  homocysteine S-methyltransferase  35.51 
 
 		 319 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1327  homocysteine S-methyltransferase domain-containing protein  35.23 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  25.69 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  29.44 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.345042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  23.51 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  23.27 
 
 		 1191 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  23.89 
 
 		 617 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  25.78 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6804  homocysteine S-methyltransferase  28.05 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  27.57 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0405  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  23.13 
 
 		 613 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0415  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  23.13 
 
 		 613 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  26.6 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  26.11 
 
 		 300 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0839  homocysteine S-methyltransferase  27.36 
 
 		 285 aa  49.3  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  25.68 
 
 		 1136 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  26.37 
 
 		 300 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  26.11 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0441893 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  26.38 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  23.33 
 
 		 1208 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  26.17 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  23.98 
 
 		 605 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  29 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0504  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  24.69 
 
 		 605 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  22.75 
 
 		 1191 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  22.75 
 
 		 1191 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  22.27 
 
 		 1182 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.25 
 
 		 615 aa  46.2  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3952  methionine synthase I  26.83 
 
 		 319 aa  46.2  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0035  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  23.64 
 
 		 612 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  26.26 
 
 		 801 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  23.91 
 
 		 1208 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2776  homocysteine S-methyltransferase family protein  26.7 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  22.78 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1771  methionine synthase I  22.32 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  normal  0.0676063 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  27.75 
 
 		 841 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  25.11 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1268  homocysteine S-methyltransferase  20.29 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.897971 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  24.32 
 
 		 1223 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  24.29 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2547  methionine synthase I  27.27 
 
 		 340 aa  43.5  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.946299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  22.46 
 
 		 1178 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  22.39 
 
 		 1182 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  25.37 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  28.57 
 
 		 802 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  24.46 
 
 		 800 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  24.19 
 
 		 1136 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  24.87 
 
 		 791 aa  43.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1497  homocysteine S-methyltransferase  28.47 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191799  normal  0.658864 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  28.43 
 
 		 804 aa  42.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1073  methionine synthase (B12-dependent)  24.77 
 
 		 1197 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  23.87 
 
 		 807 aa  42.7  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4534  homocysteine S-methyltransferase  24.13 
 
 		 302 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  23.79 
 
 		 1169 aa  42.4  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>