54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0002 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
360 aa  740  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  98.33 
 
 
360 aa  731  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  55.3 
 
 
354 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  53.39 
 
 
354 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  41.39 
 
 
373 aa  286  4e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  42.42 
 
 
367 aa  286  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  42.13 
 
 
367 aa  284  2e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  41.85 
 
 
366 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  41.85 
 
 
366 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  41.57 
 
 
366 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  41.57 
 
 
366 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  41.01 
 
 
366 aa  276  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  40.95 
 
 
392 aa  274  2e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  41.37 
 
 
379 aa  274  2e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  40.73 
 
 
366 aa  272  5e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  40.73 
 
 
366 aa  272  5e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  38.72 
 
 
365 aa  272  5e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  40.73 
 
 
366 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  40.73 
 
 
366 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  40.73 
 
 
366 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  40.17 
 
 
366 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  39.89 
 
 
366 aa  270  3e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  40.62 
 
 
367 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  42.66 
 
 
376 aa  266  6e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  40.16 
 
 
376 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  38.48 
 
 
365 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  41.16 
 
 
393 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  40.56 
 
 
385 aa  259  5e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  37.88 
 
 
365 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  39.55 
 
 
385 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  38.06 
 
 
373 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  42.01 
 
 
379 aa  247  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  39 
 
 
362 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  39 
 
 
362 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  40.87 
 
 
397 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  39.09 
 
 
389 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  38.42 
 
 
389 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  37.75 
 
 
367 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  38.46 
 
 
380 aa  229  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  28.3 
 
 
392 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  27.54 
 
 
384 aa  111  2e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  28 
 
 
413 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  27.44 
 
 
385 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  29.03 
 
 
348 aa  97.8  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  27.46 
 
 
347 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  28.92 
 
 
348 aa  92.8  9e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  28.38 
 
 
346 aa  85.9  1e-15  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  25.42 
 
 
369 aa  76.3  8e-13  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2707  saccharopine dehydrogenase  23.94 
 
 
439 aa  52.8  1e-05  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  29.07 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  23.15 
 
 
748 aa  47  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  27.54 
 
 
380 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  24.66 
 
 
450 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3474  saccharopine dehydrogenase  26.32 
 
 
351 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>