More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0574 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  65.02 
 
 		 510 aa  657    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  63.91 
 
 		 507 aa  650    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  65.53 
 
 		 511 aa  659    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  63.31 
 
 		 507 aa  639    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  66.6 
 
 		 503 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  67.02 
 
 		 505 aa  642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  75.05 
 
 		 510 aa  780    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  64.09 
 
 		 510 aa  646    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  69.18 
 
 		 506 aa  709    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  64.43 
 
 		 510 aa  655    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  93.03 
 
 		 504 aa  958    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  64.34 
 
 		 503 aa  652    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  81.24 
 
 		 504 aa  852    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  100 
 
 		 504 aa  1028    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  67.51 
 
 		 508 aa  673    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  65.77 
 
 		 503 aa  654    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  66.2 
 
 		 509 aa  662    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  65.75 
 
 		 518 aa  629  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  60.44 
 
 		 504 aa  628  1e-179  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  60.64 
 
 		 506 aa  620  1e-176  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  63.85 
 
 		 504 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  59.96 
 
 		 501 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  58.96 
 
 		 504 aa  596  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  59.76 
 
 		 501 aa  594  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  62.55 
 
 		 509 aa  594  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  62.17 
 
 		 503 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  58.71 
 
 		 512 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  56.48 
 
 		 536 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  57.91 
 
 		 506 aa  558  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  58.57 
 
 		 504 aa  560  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  57.87 
 
 		 517 aa  551  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  56.45 
 
 		 526 aa  545  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  55.34 
 
 		 519 aa  546  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0648  malonyl-CoA synthase  61.29 
 
 		 517 aa  545  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  57.23 
 
 		 501 aa  542  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  54.83 
 
 		 539 aa  543  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  58.89 
 
 		 506 aa  543  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  55.15 
 
 		 519 aa  543  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  56.19 
 
 		 511 aa  535  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  56.2 
 
 		 500 aa  521  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1293  malonyl-CoA synthase  57.14 
 
 		 510 aa  523  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  53.28 
 
 		 547 aa  523  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  54.55 
 
 		 530 aa  520  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  54.26 
 
 		 507 aa  508  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  54.75 
 
 		 485 aa  504  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  43.45 
 
 		 507 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  44.56 
 
 		 502 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  43.47 
 
 		 504 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 		 539 aa  306  6e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.29 
 
 		 514 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  36.86 
 
 		 507 aa  292  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 		 569 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 566 aa  290  6e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  38.72 
 
 		 510 aa  289  7e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.53 
 
 		 561 aa  289  8e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.53 
 
 		 561 aa  289  9e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.53 
 
 		 561 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.42 
 
 		 512 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 		 499 aa  288  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.13 
 
 		 561 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.53 
 
 		 582 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.62 
 
 		 563 aa  286  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.05 
 
 		 510 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.62 
 
 		 563 aa  286  7e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  34.69 
 
 		 516 aa  286  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.59 
 
 		 510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.59 
 
 		 510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.59 
 
 		 510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.85 
 
 		 510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.59 
 
 		 510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.85 
 
 		 510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.59 
 
 		 510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.64 
 
 		 510 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 		 508 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34 
 
 		 510 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 591 aa  282  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 		 493 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 		 508 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.41 
 
 		 582 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 590 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.41 
 
 		 563 aa  281  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.41 
 
 		 563 aa  281  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  33.76 
 
 		 518 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  37.28 
 
 		 508 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 		 520 aa  280  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  36.95 
 
 		 513 aa  280  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  35.36 
 
 		 493 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 		 525 aa  280  6e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 		 551 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  38.11 
 
 		 510 aa  278  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.6 
 
 		 561 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  34.2 
 
 		 543 aa  276  7e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 		 521 aa  276  9e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 527 aa  274  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.02 
 
 		 510 aa  274  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 583 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 		 490 aa  274  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 503 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  36.03 
 
 		 506 aa  273  6e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.17 
 
 		 513 aa  273  7e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>