More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2947 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2947  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 369 aa  751    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0697  histidinol-phosphate aminotransferase  74.73 
 
 		 365 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0805  histidinol-phosphate aminotransferase  74.25 
 
 		 358 aa  544  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1167  histidinol-phosphate aminotransferase  69.54 
 
 		 363 aa  518  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  70.39 
 
 		 371 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1031  histidinol-phosphate aminotransferase  66.12 
 
 		 370 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0729  histidinol-phosphate aminotransferase  65.29 
 
 		 368 aa  478  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0762  histidinol-phosphate aminotransferase  65.56 
 
 		 368 aa  464  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.865966  normal  0.0190089 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  64.67 
 
 		 375 aa  464  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4374  histidinol-phosphate aminotransferase  67.04 
 
 		 396 aa  461  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279737  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5521  histidinol-phosphate aminotransferase  61.43 
 
 		 374 aa  445  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  55.92 
 
 		 366 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  53.76 
 
 		 366 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  54.87 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  52.92 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  54.89 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  53.48 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  54.6 
 
 		 364 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0353  histidinol-phosphate aminotransferase  53.16 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2951  histidinol-phosphate aminotransferase  54.85 
 
 		 374 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  54.9 
 
 		 374 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  54.34 
 
 		 374 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2681  histidinol-phosphate aminotransferase  54.02 
 
 		 357 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0426  histidinol-phosphate aminotransferase  54.02 
 
 		 357 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0405  histidinol-phosphate aminotransferase  53.74 
 
 		 357 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290947 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  53.74 
 
 		 356 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3692  histidinol-phosphate aminotransferase  53.74 
 
 		 356 aa  355  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  53.74 
 
 		 356 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  53.45 
 
 		 356 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2713  histidinol-phosphate aminotransferase  53.45 
 
 		 356 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1789  histidinol-phosphate aminotransferase  53.45 
 
 		 356 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3723  histidinol-phosphate aminotransferase  53.45 
 
 		 356 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  53.16 
 
 		 356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0344  histidinol-phosphate aminotransferase  53.45 
 
 		 357 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  42.82 
 
 		 368 aa  308  8e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  45.28 
 
 		 363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  45.94 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  44.2 
 
 		 365 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  44.88 
 
 		 365 aa  281  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  45.26 
 
 		 359 aa  268  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  45.26 
 
 		 359 aa  268  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  40.32 
 
 		 365 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  34.45 
 
 		 356 aa  206  4e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 		 360 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  31.77 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  35.11 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  32.08 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  36.84 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  32.6 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  32.6 
 
 		 358 aa  188  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  36.24 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  33.7 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  34.57 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  32.18 
 
 		 349 aa  182  9.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  36.54 
 
 		 374 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1167  aminotransferase class I and II  34.65 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.342737  normal  0.371786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  30.96 
 
 		 350 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  31.68 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  33.33 
 
 		 363 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  31.69 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  34.53 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2341  class I/II aminotransferase  31.97 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.416124  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 		 350 aa  162  9e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  35.14 
 
 		 373 aa  161  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  32.1 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0323  aminotransferase class I and II  35.03 
 
 		 347 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  32.77 
 
 		 364 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  32.52 
 
 		 369 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  29.71 
 
 		 350 aa  159  9e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2242  histidinol-phosphate aminotransferase  31.46 
 
 		 380 aa  155  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  33.97 
 
 		 360 aa  155  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  30.45 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4690  histidinol-phosphate aminotransferase  31.77 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.343336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4228  aminotransferase class I and II  31.91 
 
 		 347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  30.52 
 
 		 350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  36.48 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1917  histidinol-phosphate aminotransferase  34.09 
 
 		 453 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0201149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  36.48 
 
 		 365 aa  153  5e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  34.02 
 
 		 373 aa  153  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  29.64 
 
 		 357 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  28.45 
 
 		 371 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  29.53 
 
 		 357 aa  152  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  33.01 
 
 		 351 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  35.99 
 
 		 346 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1477  histidinol-phosphate aminotransferase  28.33 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4253  aminotransferase class I and II  31.61 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377555  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3241  histidinol-phosphate aminotransferase  31.71 
 
 		 377 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471866  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  32.34 
 
 		 362 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  31.79 
 
 		 350 aa  149  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  31.51 
 
 		 360 aa  149  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4103  histidinol phosphate aminotransferase  31.62 
 
 		 347 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  36.51 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  31.36 
 
 		 350 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  28.89 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  34.49 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  32.61 
 
 		 356 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  29.72 
 
 		 355 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>