78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2565 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2565  hypothetical protein  100 
 
 		 576 aa  1188    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333323  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2932  hypothetical protein  67.77 
 
 		 578 aa  801    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000159994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0612  hypothetical protein  66.78 
 
 		 582 aa  786    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.166851 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2241  protein of unknown function DUF181  52.6 
 
 		 587 aa  596  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173958  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2343  protein of unknown function DUF181  52.67 
 
 		 587 aa  592  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2738  protein of unknown function DUF181  51.03 
 
 		 586 aa  587  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2691  hypothetical protein  51.03 
 
 		 586 aa  587  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.864502 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2423  hypothetical protein  50.86 
 
 		 586 aa  586  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00238381  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1066  hypothetical protein  51.03 
 
 		 586 aa  587  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0179082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1002  hypothetical protein  51.03 
 
 		 586 aa  587  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.332512  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00916  hypothetical protein  51.03 
 
 		 586 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1011  hypothetical protein  51.03 
 
 		 586 aa  587  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000298438  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00909  hypothetical protein  51.03 
 
 		 586 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2216  hypothetical protein  51.03 
 
 		 586 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.522723  normal  0.321049 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1039  hypothetical protein  50.52 
 
 		 586 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.548133  normal  0.203105 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0980  hypothetical protein  50.52 
 
 		 597 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00400135  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1088  hypothetical protein  50.52 
 
 		 611 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.654387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1073  hypothetical protein  50.34 
 
 		 597 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788303  normal  0.409514 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1008  hypothetical protein  50.69 
 
 		 611 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1425  hypothetical protein  50.34 
 
 		 586 aa  578  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.824732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1731  hypothetical protein  51.3 
 
 		 587 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219135  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1704  hypothetical protein  51.56 
 
 		 587 aa  568  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.202332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1948  hypothetical protein  50.6 
 
 		 588 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00321676  normal  0.0629552 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2587  hypothetical protein  50.6 
 
 		 588 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2675  hypothetical protein  50.6 
 
 		 588 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1999  protein of unknown function DUF181  50.78 
 
 		 587 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86626  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  46.1 
 
 		 728 aa  518  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3033  hypothetical protein  45.39 
 
 		 728 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.431186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  46.43 
 
 		 727 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  45.57 
 
 		 728 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3343  hypothetical protein  44 
 
 		 728 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.987058 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3253  hypothetical protein  44.97 
 
 		 728 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  46.56 
 
 		 734 aa  508  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3489  hypothetical protein  44.35 
 
 		 742 aa  503  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  44.35 
 
 		 729 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  44.58 
 
 		 728 aa  503  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3321  hypothetical protein  44.35 
 
 		 742 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  45.1 
 
 		 728 aa  505  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  44.44 
 
 		 728 aa  502  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  44.17 
 
 		 729 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  44 
 
 		 729 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  45.52 
 
 		 732 aa  501  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  44.54 
 
 		 728 aa  501  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0632  hypothetical protein  44.17 
 
 		 742 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0795  hypothetical protein  43.92 
 
 		 592 aa  501  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4822  hypothetical protein  46.42 
 
 		 734 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000227003  normal  0.373155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  44.35 
 
 		 728 aa  495  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  44 
 
 		 729 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2832  hypothetical protein  44.08 
 
 		 728 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39610  hypothetical protein  45.14 
 
 		 616 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.812583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  44.6 
 
 		 728 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806493 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0034  hypothetical protein  45.96 
 
 		 735 aa  492  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3620  hypothetical protein  44.43 
 
 		 728 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2113  hypothetical protein  44.43 
 
 		 728 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2710  hypothetical protein  45.08 
 
 		 731 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  45.27 
 
 		 734 aa  490  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0890  protein of unknown function DUF181  46.84 
 
 		 592 aa  489  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  45.58 
 
 		 734 aa  488  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  45.34 
 
 		 734 aa  483  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1265  hypothetical protein  41.2 
 
 		 584 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0114  hypothetical protein  34.09 
 
 		 536 aa  342  9e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0463  protein of unknown function DUF181  33.22 
 
 		 540 aa  334  2e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3580  hypothetical protein  28.97 
 
 		 618 aa  167  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000420617  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  29.07 
 
 		 584 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  26.56 
 
 		 403 aa  51.2  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  25.89 
 
 		 580 aa  50.8  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  33.59 
 
 		 572 aa  50.4  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  26.12 
 
 		 575 aa  50.4  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  23.6 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  24.26 
 
 		 584 aa  50.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  26.46 
 
 		 745 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  26.46 
 
 		 745 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  26.59 
 
 		 575 aa  47.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  25.83 
 
 		 882 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  26.75 
 
 		 389 aa  44.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  24.45 
 
 		 403 aa  44.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  25.68 
 
 		 745 aa  44.3  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  24.77 
 
 		 745 aa  43.9  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>