More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0085 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0085  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 272 aa  544  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420165  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3958  nucleotidyl transferase  65.53 
 
 		 271 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3308  nucleotidyl transferase  65.53 
 
 		 271 aa  328  6e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0194  nucleotidyl transferase  64.39 
 
 		 247 aa  313  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0983981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5261  Nucleotidyl transferase  62.5 
 
 		 236 aa  295  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4057  nucleotidyl transferase  62.88 
 
 		 245 aa  294  8e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4583  nucleotidyl transferase  62.88 
 
 		 263 aa  288  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.693762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0937  nucleotidyl transferase  56.82 
 
 		 272 aa  251  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4828  nucleotidyl transferase  55.3 
 
 		 232 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0257  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  50.76 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  46.55 
 
 		 250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2335  putative nucleotidyl transferase  47.76 
 
 		 237 aa  179  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.512409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0218  nucleotidyl transferase  42.64 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0125725 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  42.26 
 
 		 226 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1576  Nucleotidyl transferase  42.16 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0673  Nucleotidyl transferase  44.36 
 
 		 242 aa  165  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  42.07 
 
 		 225 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2073  nucleotidyl transferase  39.31 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  45.49 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1872  nucleotidyl transferase  41.42 
 
 		 236 aa  162  7e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  41.64 
 
 		 225 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  41.91 
 
 		 226 aa  161  9e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2740  nucleotidyl transferase  44.74 
 
 		 240 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0493  nucleotidyl transferase  43.61 
 
 		 245 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  40.89 
 
 		 225 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  41.7 
 
 		 225 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  44.74 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4026  putative nucleotidyl transferase  43.82 
 
 		 241 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2101  nucleotidyl transferase  44.36 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.539682  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2713  nucleotidyl transferase  44.36 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  42.11 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  45.45 
 
 		 232 aa  158  9e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0433  nucleotidyl transferase  41.2 
 
 		 232 aa  158  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73488  normal  0.148714 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0206  nucleotidyltransferase family protein  43.23 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2739  nucleotidyltransferase family protein  43.23 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0690  nucleotidyl transferase family protein  43.23 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0868  nucleotidyltransferase family protein  43.23 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  41.35 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0394  nucleotidyl transferase  41.95 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824565  normal  0.063826 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2339  nucleotidyltransferase family protein  43.23 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329535  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  45.49 
 
 		 222 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2419  nucleotidyltransferase family protein  43.23 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0704  nucleotidyl transferase family protein  42.86 
 
 		 239 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  41.67 
 
 		 239 aa  156  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245528  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0586  nucleotidyl transferase  43.23 
 
 		 240 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  41.2 
 
 		 222 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  40.07 
 
 		 222 aa  155  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0127  nucleotidyl transferase  42.44 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  40.15 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  41.51 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2631  nucleotidyl transferase  42.86 
 
 		 239 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  39.39 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0387  Nucleotidyl transferase  42.11 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  43.33 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2765  nucleotidyl transferase  42.48 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  42.26 
 
 		 243 aa  148  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0402  Nucleotidyl transferase  40.96 
 
 		 234 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  44.44 
 
 		 223 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  38.64 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  43.51 
 
 		 223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  44.62 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0573  nucleotidyltransferase family protein  41.35 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  43.18 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  37.1 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  42.69 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  40.15 
 
 		 223 aa  142  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0511  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  40 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.560778  normal  0.0591515 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  44.62 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  40.53 
 
 		 228 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  40.77 
 
 		 223 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  42.75 
 
 		 223 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  42.05 
 
 		 221 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1752  nucleotidyl transferase  37.97 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  41.54 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  43.46 
 
 		 224 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  37.78 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0556  nucleotidyltransferase family protein  42.4 
 
 		 210 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  39.18 
 
 		 236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  37.41 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  38.89 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  37.05 
 
 		 240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1696  nucleotidyl transferase  36.74 
 
 		 242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  38.11 
 
 		 229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  38.11 
 
 		 229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  38.64 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  35.47 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1517  nucleotidyl transferase  35.23 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.631437  normal  0.41315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2431  nucleotidyl transferase  40.15 
 
 		 223 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  40 
 
 		 222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  33.08 
 
 		 219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.08 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  33.58 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  34.34 
 
 		 220 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  33.58 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  30.22 
 
 		 243 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  42.86 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  30.68 
 
 		 232 aa  86.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  39.42 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  34.6 
 
 		 244 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0327  putative nucleotidyl transferase  30.43 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>