91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3920 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  620  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  74.82 
 
 		 343 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2566  hypothetical protein  38.24 
 
 		 295 aa  165  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.0363066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5084  hypothetical protein  38.21 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  43.06 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  34.69 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1230  hypothetical protein  36.23 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  40.47 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  39.93 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  40.81 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2954  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  32.41 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  32.13 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  32.16 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1019  hypothetical protein  43.24 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237359  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  33.33 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  32.47 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1542  hydrolase  36.07 
 
 		 277 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  35.47 
 
 		 279 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3100  hypothetical protein  41.09 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00381116  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1908  hypothetical protein  36.4 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.714341  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2857  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  34.01 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0064  hypothetical protein  38.21 
 
 		 305 aa  92.8  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6287  Protein of unknown function DUF829  24.36 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000137217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1979  hydrolase, putative  33.18 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708266  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  31.56 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1510  hydrolase  34.98 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0758387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2000  putative hydrolase  35.47 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3781  hypothetical protein  34.98 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  33.49 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23610  putative hydrolase  35.12 
 
 		 285 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  32.89 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02180  hypothetical protein  25 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0078  hypothetical protein  29.26 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12443  hypothetical protein  28.38 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.134258  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06957  hypothetical protein  22.95 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  21.05 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2228  hypothetical protein  31.65 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  23.83 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  22.7 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  31.78 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_003296  RS02220  hypothetical protein  31.76 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  30.23 
 
 		 270 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2021  hypothetical protein  30 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3537  hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  41.94 
 
 		 364 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0692853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 270 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0131  putative hydrolase  37.72 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  24.88 
 
 		 271 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.3 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  34.19 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  34.19 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  34.19 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  29.35 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  34.19 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  34.19 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  34.19 
 
 		 280 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13371  predicted protein  50 
 
 		 323 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014385  normal  0.0363767 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  34.19 
 
 		 280 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 		 347 aa  46.2  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  26.05 
 
 		 281 aa  46.2  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 		 268 aa  45.8  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.36 
 
 		 370 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  27.09 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  24.49 
 
 		 254 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  30.77 
 
 		 273 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  38.54 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  21.95 
 
 		 250 aa  44.3  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  25.32 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  32.61 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  22.46 
 
 		 253 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  25.22 
 
 		 309 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  34.75 
 
 		 293 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 		 270 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 		 270 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0856  alpha/beta hydrolase fold protein  41 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  35.25 
 
 		 322 aa  42.7  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 310 aa  42.7  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  34.65 
 
 		 318 aa  42.7  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.54 
 
 		 370 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6100  predicted protein  43.9 
 
 		 253 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00681545  normal  0.399309 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 289 aa  42.4  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  27.98 
 
 		 322 aa  42.4  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 		 253 aa  42.4  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  33.01 
 
 		 340 aa  42.4  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>