71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3650 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3650  CheW protein  100 
 
 		 225 aa  447  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107896  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3970  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  58.9 
 
 		 250 aa  248  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000212039  hitchhiker  0.0041707 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1491  CheW domain-containing protein  44.44 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000195231  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4231  putative CheW protein  44.44 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1096  CheW protein  42.2 
 
 		 221 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.153582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3976  CheW protein  40.77 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16460  CheW domain-containing protein  40.81 
 
 		 229 aa  151  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4127  CheW protein  41.12 
 
 		 221 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0808304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5392  CheW protein  41.38 
 
 		 233 aa  148  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0504  chemotaxis protein cheW  39.39 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369633  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3734  CheW protein  38.3 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3790  CheW protein  38.3 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4573  CheW protein  38.3 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468736  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0257  chemotaxis protein cheW  36.67 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2539  CheW domain-containing protein  36.67 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155706  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1598  chemotaxis protein cheW  36.67 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1401  chemotaxis protein cheW  36.67 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1055  CheW protein  42.33 
 
 		 227 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2684  CheW domain-containing protein  36.36 
 
 		 246 aa  141  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1432  hypothetical protein  40.36 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1306  CheW-like protein  39.82 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2056  CheW protein  34.17 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2030  CheW protein  34.17 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1496  CheW domain protein  40.27 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2305  CheW protein  37.33 
 
 		 235 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1524  CheW protein  32.59 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3682  CheW protein  37.83 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5516  CheW protein  35.78 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334912  normal  0.661174 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4943  CheW protein  37.12 
 
 		 247 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318865  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0830  CheW-like domain-containing protein  34.42 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0220  chemotaxis protein cheW  41.5 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.981977  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0965  chemotaxis protein cheW  41.5 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  28.78 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  36.52 
 
 		 179 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  35.65 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  35.65 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  34.01 
 
 		 531 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0237  putative CheW protein  36.62 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  30.94 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1585  chemotaxis protein, CheW2  36.62 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  30.22 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  33.78 
 
 		 172 aa  47.4  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0860  CheW protein  28.33 
 
 		 319 aa  46.2  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.288047  normal  0.124717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  35.45 
 
 		 479 aa  45.4  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  19.01 
 
 		 192 aa  45.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2398  CheW protein  32.04 
 
 		 192 aa  45.1  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.773649 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4463  putative CheW protein  34.69 
 
 		 137 aa  45.1  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.4 
 
 		 165 aa  45.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  30 
 
 		 179 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  25.9 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  23.62 
 
 		 154 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  29.5 
 
 		 184 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  23.81 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  22.63 
 
 		 161 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  27.52 
 
 		 159 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  29.5 
 
 		 184 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  28.38 
 
 		 167 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.24 
 
 		 173 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.24 
 
 		 173 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0265  putative CheW protein  35.21 
 
 		 163 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1637  putative CheA signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 399 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.24 
 
 		 173 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  21.54 
 
 		 163 aa  42.7  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  25.32 
 
 		 158 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  30.43 
 
 		 183 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  24.03 
 
 		 158 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.4 
 
 		 165 aa  42.4  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  29.92 
 
 		 179 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  23.74 
 
 		 159 aa  42  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  24.06 
 
 		 159 aa  42  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  20.74 
 
 		 159 aa  42  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>