More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3336 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  100 
 
 
259 aa  519  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  76.45 
 
 
259 aa  407  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  66.54 
 
 
257 aa  353  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  49.61 
 
 
238 aa  243  2e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  28.8 
 
 
223 aa  140  2e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  61.76 
 
 
115 aa  136  3e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  51.75 
 
 
125 aa  132  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  58 
 
 
107 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  51.92 
 
 
109 aa  130  2e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  7.55865e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  57 
 
 
107 aa  129  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  52.94 
 
 
105 aa  129  4e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  48.65 
 
 
114 aa  129  4e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  54.29 
 
 
107 aa  129  4e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  55.24 
 
 
109 aa  129  5e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  51.43 
 
 
106 aa  129  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  56 
 
 
107 aa  128  7e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  56.31 
 
 
108 aa  127  1e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  56 
 
 
107 aa  128  1e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  56 
 
 
107 aa  128  1e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  56 
 
 
107 aa  128  1e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  52.78 
 
 
124 aa  127  2e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  56 
 
 
107 aa  127  2e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  56 
 
 
107 aa  127  2e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  52.83 
 
 
114 aa  127  2e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  52.94 
 
 
108 aa  127  2e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  7.56824e-06  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  53.47 
 
 
107 aa  127  2e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  5.34537e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  54 
 
 
107 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  54 
 
 
107 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  52.94 
 
 
108 aa  126  4e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  56 
 
 
107 aa  126  4e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  53.92 
 
 
108 aa  126  5e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  55 
 
 
107 aa  125  6e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  50.96 
 
 
110 aa  125  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  54.05 
 
 
150 aa  125  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  53 
 
 
148 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  51.35 
 
 
120 aa  125  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  53.47 
 
 
106 aa  125  8e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  53.47 
 
 
105 aa  125  9e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  48.62 
 
 
112 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  54 
 
 
109 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  53.85 
 
 
110 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  46.73 
 
 
109 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  50.48 
 
 
109 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  51.92 
 
 
110 aa  123  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  46.79 
 
 
109 aa  123  3e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  53.4 
 
 
109 aa  123  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  54.46 
 
 
107 aa  123  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  51.43 
 
 
107 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  49.52 
 
 
107 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  55.67 
 
 
106 aa  122  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  46.73 
 
 
109 aa  122  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  54.29 
 
 
110 aa  122  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  1.31883e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  52.53 
 
 
107 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  52.94 
 
 
108 aa  122  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  54 
 
 
107 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  49.51 
 
 
107 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  48.54 
 
 
109 aa  122  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  53.06 
 
 
108 aa  122  8e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  52.34 
 
 
110 aa  121  1e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  46.15 
 
 
109 aa  120  1e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  121  1e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  48.57 
 
 
107 aa  120  2e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  48.08 
 
 
109 aa  120  2e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  47.57 
 
 
113 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  49.02 
 
 
110 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  49.53 
 
 
110 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  51.43 
 
 
110 aa  119  4e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  51 
 
 
123 aa  119  4e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  57.58 
 
 
106 aa  119  5e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  47.57 
 
 
109 aa  119  5e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  52 
 
 
110 aa  118  9e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  47.57 
 
 
108 aa  118  9e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  46.53 
 
 
107 aa  118  1e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  52.69 
 
 
110 aa  118  1e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  50.48 
 
 
112 aa  118  1e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  49.48 
 
 
107 aa  118  1e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  53 
 
 
108 aa  118  1e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  53.85 
 
 
107 aa  118  1e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  54.26 
 
 
110 aa  117  2e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  49.04 
 
 
109 aa  117  2e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  4.29326e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  47.62 
 
 
108 aa  117  2e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  53.85 
 
 
107 aa  117  2e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  54.9 
 
 
107 aa  116  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  57.61 
 
 
110 aa  116  4e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  48 
 
 
108 aa  116  4e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  49.02 
 
 
104 aa  116  4e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  49.02 
 
 
109 aa  116  4e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  49.02 
 
 
104 aa  116  4e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  46.53 
 
 
109 aa  115  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  47.12 
 
 
109 aa  115  7e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  47 
 
 
108 aa  115  8e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  54.74 
 
 
109 aa  115  9e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  47.12 
 
 
107 aa  115  9e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  46.67 
 
 
108 aa  114  1e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  49.52 
 
 
104 aa  114  1e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.56705e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  45.71 
 
 
107 aa  114  1e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  9.46631e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  45.71 
 
 
108 aa  114  1e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  51.65 
 
 
109 aa  114  1e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>