More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3050 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  100 
 
 
250 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  89.8 
 
 
248 aa  457  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  65.25 
 
 
250 aa  315  5e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  53.18 
 
 
251 aa  249  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  50.62 
 
 
255 aa  235  6e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  49.8 
 
 
298 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  46.69 
 
 
253 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  48.58 
 
 
252 aa  231  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  48.96 
 
 
245 aa  227  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  46.4 
 
 
256 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  45.19 
 
 
233 aa  178  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  35.71 
 
 
238 aa  178  5.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  39.63 
 
 
233 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  41.59 
 
 
253 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  40.59 
 
 
250 aa  170  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  41.03 
 
 
231 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  38.43 
 
 
238 aa  168  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  41.81 
 
 
244 aa  166  5e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  36.03 
 
 
241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  37.96 
 
 
242 aa  159  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  38.56 
 
 
237 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  40.27 
 
 
602 aa  157  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  40.91 
 
 
233 aa  156  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  37.45 
 
 
230 aa  155  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  37.67 
 
 
237 aa  154  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  35.15 
 
 
238 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  38.84 
 
 
240 aa  149  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  39.33 
 
 
235 aa  148  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  42.47 
 
 
250 aa  148  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  42.47 
 
 
250 aa  148  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  35.56 
 
 
241 aa  148  8e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  38.68 
 
 
238 aa  144  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  36.16 
 
 
279 aa  144  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  44.6 
 
 
254 aa  143  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  31.71 
 
 
312 aa  139  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  41.33 
 
 
231 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  36.06 
 
 
245 aa  139  6e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  41.86 
 
 
239 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  36.99 
 
 
237 aa  138  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  40 
 
 
238 aa  137  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  35.12 
 
 
253 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0847  peptidase C26  45.5 
 
 
246 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  39.49 
 
 
242 aa  135  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  40.19 
 
 
238 aa  135  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0108  peptidase C26  40.66 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  43 
 
 
252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  44.22 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  38.54 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  38.91 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  36.73 
 
 
254 aa  133  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  39.09 
 
 
250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  44.32 
 
 
266 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0813  peptidase C26  36.28 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  36.04 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  37.67 
 
 
278 aa  129  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  37.67 
 
 
278 aa  129  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  38.21 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2645  glutamine amidotransferase  36.04 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4597  peptidase C26  36.05 
 
 
307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  37.73 
 
 
236 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  37.45 
 
 
242 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  37.73 
 
 
236 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  38.99 
 
 
247 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  37.73 
 
 
236 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1092  peptidase C26  34.93 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337501  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  37.16 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  39.59 
 
 
285 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  35.35 
 
 
227 aa  127  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0710  peptidase C26  36.73 
 
 
263 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.391948  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1786  peptidase C26  38.76 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  38.29 
 
 
236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4678  hypothetical protein  36.55 
 
 
255 aa  125  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  38.43 
 
 
243 aa  125  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  39.72 
 
 
241 aa  125  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  37.32 
 
 
229 aa  124  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1106  peptidase C26  37.23 
 
 
268 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442866  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  34.6 
 
 
240 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1106  peptidase C26  34.65 
 
 
253 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2179  peptidase C26  39.52 
 
 
257 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3194  peptidase C26  34.65 
 
 
253 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0388042 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3963  peptidase C26  35.27 
 
 
305 aa  123  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0830128  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1197  peptidase C26  34.65 
 
 
253 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0734619  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1164  peptidase C26  34.65 
 
 
253 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.399023  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3313  peptidase C26  35.27 
 
 
305 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3558  peptidase C26  38.76 
 
 
257 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2816  peptidase C26  36.53 
 
 
255 aa  122  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6342  peptidase C26  36.7 
 
 
262 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  38.54 
 
 
238 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  36.07 
 
 
261 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3012  peptidase C26  35.24 
 
 
254 aa  122  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2381  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  37.96 
 
 
255 aa  122  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00995781  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3002  peptidase C26  33.77 
 
 
253 aa  122  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00604755  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  40.1 
 
 
260 aa  121  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1900  glutamine amidotransferase-like protein  38.33 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.720243  normal  0.134841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  36.1 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  36.24 
 
 
249 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48870  glutamine amidotransferase  37.89 
 
 
250 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0244  glutamine amidotransferase  35.27 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.682625  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08940  predicted glutamine amidotransferase  34.93 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0342497  normal  0.666279 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6978  peptidase C26  32.95 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>