More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0401 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  100 
 
 		 362 aa  731    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  87.15 
 
 		 382 aa  647    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  84.81 
 
 		 382 aa  636    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  59.56 
 
 		 368 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0348  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  58.22 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  59.95 
 
 		 368 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  59.67 
 
 		 368 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  59.89 
 
 		 370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  59.67 
 
 		 368 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  59.94 
 
 		 368 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  57.18 
 
 		 375 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0295  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  59.44 
 
 		 405 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  59.4 
 
 		 368 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  59.4 
 
 		 368 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  59.4 
 
 		 368 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  54.77 
 
 		 369 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  59.4 
 
 		 368 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  59.4 
 
 		 368 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  59.4 
 
 		 368 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  56.76 
 
 		 353 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  59.4 
 
 		 368 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2715  A/G-specific adenine glycosylase  59.02 
 
 		 381 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.197522 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2857  A/G-specific adenine glycosylase  58.74 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  54.35 
 
 		 383 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  55.1 
 
 		 359 aa  354  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2130  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  52.68 
 
 		 344 aa  347  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  50.28 
 
 		 355 aa  346  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  51.69 
 
 		 368 aa  346  3e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  49.44 
 
 		 355 aa  339  5e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.3 
 
 		 355 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.98 
 
 		 345 aa  334  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.31 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  49.72 
 
 		 355 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  51.12 
 
 		 362 aa  330  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  49.16 
 
 		 355 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  49.16 
 
 		 355 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  48.6 
 
 		 355 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  44.82 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  48.89 
 
 		 355 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1621  A/G-specific adenine glycosylase  46.17 
 
 		 381 aa  317  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.865832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3235  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  54.08 
 
 		 368 aa  316  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.88 
 
 		 348 aa  314  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  46.24 
 
 		 350 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  48.02 
 
 		 374 aa  311  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67990  A/G-specific adenine glycosylase  50.83 
 
 		 355 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.259301  normal  0.0147952 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1916  A/G-specific adenine glycosylase  43.55 
 
 		 381 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  49.31 
 
 		 353 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  49.72 
 
 		 357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.9 
 
 		 353 aa  302  6.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  46.6 
 
 		 365 aa  299  6e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  44.96 
 
 		 354 aa  298  8e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  49.17 
 
 		 357 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.24 
 
 		 355 aa  297  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0937  A/G-specific adenine glycosylase  46.26 
 
 		 349 aa  296  3e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.96 
 
 		 363 aa  296  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.9 
 
 		 372 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.9 
 
 		 372 aa  295  7e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  48.9 
 
 		 372 aa  295  7e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  46.5 
 
 		 382 aa  295  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  44.75 
 
 		 358 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  43.26 
 
 		 354 aa  293  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  42.12 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01430  A/G-specific adenine glycosylase  47.24 
 
 		 357 aa  291  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229953  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  46.01 
 
 		 384 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  42.19 
 
 		 368 aa  290  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  43.54 
 
 		 361 aa  290  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  42.78 
 
 		 381 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  42.62 
 
 		 355 aa  290  3e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  48.47 
 
 		 370 aa  290  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  47.34 
 
 		 344 aa  290  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  44.41 
 
 		 368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  46.28 
 
 		 356 aa  288  9e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1056  A/G-specific adenine glycosylase  47.37 
 
 		 349 aa  288  1e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.992561  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.22 
 
 		 357 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  45.17 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  44.62 
 
 		 370 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  41.41 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  41.69 
 
 		 360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  50.16 
 
 		 361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  41.69 
 
 		 350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  41.69 
 
 		 350 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  41.69 
 
 		 350 aa  286  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  43.61 
 
 		 358 aa  286  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  45.03 
 
 		 354 aa  286  4e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  41.69 
 
 		 350 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  41.57 
 
 		 360 aa  286  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  41.69 
 
 		 350 aa  286  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  41.41 
 
 		 350 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  41.29 
 
 		 360 aa  286  5.999999999999999e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  41.41 
 
 		 350 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  41.13 
 
 		 350 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  41.41 
 
 		 350 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  41.41 
 
 		 350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  41.13 
 
 		 350 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  44.41 
 
 		 368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  42.66 
 
 		 363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  41.83 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  41.55 
 
 		 372 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  42.06 
 
 		 350 aa  278  8e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  45.94 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>