285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0323 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0323  lipoate-protein ligase B  100 
 
 		 229 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0185  lipoate-protein ligase B  93.89 
 
 		 229 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.901872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0179  lipoate-protein ligase B  93.45 
 
 		 229 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0053  lipoate-protein ligase B  65.58 
 
 		 257 aa  289  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0219  lipoate-protein ligase B  65.58 
 
 		 249 aa  289  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0626  lipoate-protein ligase B  65.58 
 
 		 254 aa  289  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0443  lipoate-protein ligase B  65.58 
 
 		 252 aa  289  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3187  lipoate-protein ligase B  65.58 
 
 		 249 aa  289  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.498526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1374  lipoate-protein ligase B  65.58 
 
 		 249 aa  289  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0463  lipoate-protein ligase B  65.58 
 
 		 246 aa  289  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0385  lipoate-protein ligase B  66.05 
 
 		 255 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.915915  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0085  lipoate-protein ligase B  75.94 
 
 		 236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51227  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0060  lipoate-protein ligase B  78.14 
 
 		 264 aa  278  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0503  lipoate-protein ligase B  68.81 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.052969 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2898  lipoate-protein ligase B  66.36 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6231  lipoate-protein ligase B  66.82 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.526565 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2273  lipoate-protein ligase B  66.82 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2888  lipoate-protein ligase B  66.36 
 
 		 251 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2800  lipoate-protein ligase B  64.25 
 
 		 251 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2938  lipoate-protein ligase B  64.25 
 
 		 251 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0216  lipoate-protein ligase B  68.04 
 
 		 255 aa  262  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4213  lipoate-protein ligase B  67.43 
 
 		 241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0416  lipoate-protein ligase B  65.89 
 
 		 248 aa  257  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110487  normal  0.120766 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1962  lipoyltransferase  59.14 
 
 		 214 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  64.2 
 
 		 205 aa  231  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1669  lipoyltransferase  60 
 
 		 214 aa  230  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3935  lipoate-protein ligase B  51.1 
 
 		 230 aa  225  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385529  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2630  lipoate-protein ligase B  56.5 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0400  lipoate-protein ligase B  51.14 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0243  lipoate-protein ligase B  48.91 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1554  lipoate-protein ligase B  54.26 
 
 		 217 aa  215  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00660992  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  57.84 
 
 		 216 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004227  octanoate-[acyl-carrier-protein]-protein-N- octanoyltransferase  48.66 
 
 		 220 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000231315  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  57.84 
 
 		 215 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4880  lipoate-protein ligase B  50.22 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0985  lipoate-protein ligase B  53.26 
 
 		 217 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000234389  normal  0.0349218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1050  lipoate-protein ligase B  53.26 
 
 		 217 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000221543  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0989  lipoate-protein ligase B  53.26 
 
 		 217 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000765019  normal  0.947526 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3029  lipoate-protein ligase B  57.63 
 
 		 216 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.572663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4964  lipoate-protein ligase B  58.29 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  59.02 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  54.8 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1162  lipoate-protein ligase B  53.26 
 
 		 219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  50.67 
 
 		 218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0868  lipoate-protein ligase B  51.53 
 
 		 227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  56.76 
 
 		 215 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01212  lipoate-protein ligase B  48.21 
 
 		 220 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  57.3 
 
 		 215 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  51.42 
 
 		 218 aa  211  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0315  lipoate-protein ligase B  50.89 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  60.61 
 
 		 218 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0693  lipoate-protein ligase B  52.72 
 
 		 216 aa  210  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0468  lipoate-protein ligase B  56.07 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000117999  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2594  lipoate-protein ligase B  51.31 
 
 		 216 aa  209  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00491142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3714  lipoate-protein ligase B  52.25 
 
 		 219 aa  208  7e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000923711  hitchhiker  0.00434688 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  52.69 
 
 		 224 aa  207  9e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0980  lipoate-protein ligase B  53.76 
 
 		 228 aa  207  9e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33716  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  58.33 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2875  lipoate-protein ligase B  51.37 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00372643  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  51.66 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0314  lipoate-protein ligase B  42.97 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  54.04 
 
 		 203 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01650  Lipoate-protein ligase B  55.81 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00106577  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0299  lipoate-protein ligase B  52.97 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479336 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0363  lipoate-protein ligase B  48.71 
 
 		 231 aa  205  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0294  lipoate-protein ligase B  52.97 
 
 		 226 aa  205  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  53.26 
 
 		 236 aa  205  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3491  lipoate-protein ligase B  51.69 
 
 		 219 aa  204  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000205489 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1988  lipoate-protein ligase B  50.24 
 
 		 215 aa  204  9e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0471  lipoate-protein ligase B  53.69 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3459  lipoate-protein ligase B  51.37 
 
 		 217 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.139271  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3323  lipoate-protein ligase B  51.37 
 
 		 217 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00233986  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  55.56 
 
 		 217 aa  204  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3281  lipoate-protein ligase B  51.37 
 
 		 217 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00157558  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1710  lipoate-protein ligase B  52.57 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.905957  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3155  lipoate-protein ligase B  51.12 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2941  lipoate-protein ligase B  54.44 
 
 		 218 aa  203  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188229  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1086  lipoate-protein ligase B  52.57 
 
 		 217 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000359181  hitchhiker  0.00000877638 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2408  lipoate-protein ligase B  53.14 
 
 		 212 aa  201  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1112  lipoate-protein ligase B  50 
 
 		 217 aa  201  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12120  lipoate-protein ligase B  50 
 
 		 217 aa  201  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1165  lipoyltransferase  54.91 
 
 		 213 aa  201  9e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  52.54 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  55.06 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  54.49 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1264  lipoate-protein ligase B  55.29 
 
 		 211 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0529911  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2969  lipoate-protein ligase B  53.45 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0316  lipoate-protein ligase B  53.3 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.152256  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  50.27 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0411  lipoate-protein ligase B  46.41 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  49.13 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  52.51 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  48.55 
 
 		 199 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0795  lipoate-protein ligase B  51.06 
 
 		 213 aa  195  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0561601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  53.14 
 
 		 233 aa  194  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  54.39 
 
 		 227 aa  194  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000926852  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0691  lipoate-protein ligase B  51.06 
 
 		 213 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0223479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0751  lipoate-protein ligase B  51.06 
 
 		 213 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0737  lipoate-protein ligase B  51.06 
 
 		 213 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00974636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0677  lipoate-protein ligase B  51.06 
 
 		 213 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000835576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>