More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1819 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 331 aa  682    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  79.52 
 
 		 331 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  78.42 
 
 		 334 aa  541  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  57.01 
 
 		 328 aa  363  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  48.66 
 
 		 323 aa  315  5e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  48.08 
 
 		 343 aa  310  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 		 314 aa  259  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  41.46 
 
 		 315 aa  249  4e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  38.79 
 
 		 323 aa  246  4e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  40.48 
 
 		 311 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  42.51 
 
 		 322 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  41.9 
 
 		 341 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  38.15 
 
 		 323 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  41.27 
 
 		 315 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  41.27 
 
 		 315 aa  206  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  36.62 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  35.09 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  38.77 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  37.5 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  37.66 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  34.36 
 
 		 315 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  33.84 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  34.64 
 
 		 345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  32.81 
 
 		 308 aa  155  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  32.01 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 		 344 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 289 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  32.45 
 
 		 356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  30.42 
 
 		 311 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 288 aa  136  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 		 290 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  28.66 
 
 		 288 aa  133  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 		 287 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 308 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  29.22 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 		 293 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 		 287 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 		 288 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 283 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  26.5 
 
 		 289 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.54 
 
 		 350 aa  126  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  27.9 
 
 		 284 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 287 aa  125  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 		 287 aa  125  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  26.5 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  30.7 
 
 		 304 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 297 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  28.31 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  28.17 
 
 		 289 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 		 328 aa  119  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  29.54 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05183  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14860)  26.63 
 
 		 780 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  28.85 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  43.09 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  29.11 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.48 
 
 		 266 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 276 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  28.12 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  28.12 
 
 		 349 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  28.12 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  28.12 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  28.12 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  28.12 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  28.12 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  25.99 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  28.71 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4021  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 341 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.655043  normal  0.26756 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  42.37 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  28.48 
 
 		 266 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5525  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>